正态分布（Normal distribution），也称“常态分布”，又名高斯分布在很多领域都是非常重要的概率分布，可以说在整个自然界都非常常见 简单来说正态分布直方图由柱形...
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手把手教你做正态分布直方图 -
群体进化-GWAS分析
群体进化-gwas分析 群体进化基础分析 PCA 分析原理PCA(Principal Component Analysis)，即主成分分析方法，是一种使用最广泛的数据...
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【豆科基因组】大豆适应性位点GWAS分析[转载]本文利用99085个高质量SNP 通过STRUCTURE，PCA和neighbour-joining tree的群体结构分析将地方品种分为三个亚群，这些亚群表现出地理上的遗传...
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R语言 改变列的名称 change column names
利用colnames(df)获取dataframe的所有列的名称，之后的操作便在此基础上展开 综上可以看出，右侧为列的新名称字符串或者向量，左侧的重点在于找到需要重命名的列的...
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地理信息科学 时空数据挖掘 空间分析与统计<br>
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使用qqman包绘制曼哈顿图和QQ图安装并加载所需R包 基本数据格式：SNP名称，所在染色体，SNP位置，Pvalue值 绘制曼哈顿图 基本使用 常用参数 默认绘图 绘制QQ图 默认绘图
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复现《nature communications》图表（五）：GWAS曼哈顿图和qq图复现
NC文章的全基因组部分，关于GWAS的一些图本来不想复现，但是看到近期很多文章包括单细胞总是会挖掘GWAS用于自己的研究，而小编负责的课题也涉及到这一部分，所以还是决定试一下...
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用R语言进行相关性分析：画出散点图、拟合线及标注相关系数和P值一. 读取数据 因为我们一般自己录的数据都是excel表格的，对于读取excel，此处有一个小技巧 读取excel方法 1.把excel文件另存为CSV文件 2.按照读取cs...
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拟南芥自交植株雄性配子数量的适应性减少今天分享一篇来自nature communication上的文章，发表于今年6月份，题目为：Adaptive reduction of male gamete number ...
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GWAS - 基因型与表型的关联分析流程这里介绍的SNP数据与单一表型的相关分析流程 一、准备plink文件 ped和map文件转换为bed、fam、bim mydata为ped和map的文件名，不需要加后缀mak...
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仰望星空，脚踏实地
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波屯搬砖ing
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深夜有感
不知道，为什么，做什么事情结果总是和初衷不一样，这个世界，有越来越多的表观，每个人都披着外衣，课题组身边的人，老师都是，只为了自己的利益，甚至失去做人的底线，不管怎么样，不在...
