您好 私信发不了呢
Orthofinder2鉴定单拷贝基因并构建进化树实验目的：比较基因组学，从基因组获取单拷贝基因，并构建有根的进化树，并估计分化时间，最终画出有分化时间的进化树实验流程：orthofinder2获取单拷贝基因——muscle...
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rgene_gamma计算2023-10-02rgene_gamma计算，准备如下两个文件，以及ctl配置文件 树文件：请注意，根节点需要一个简单的化石校准，比如“@4.5”（450Ma ago）。如果没有这个标记计算出...
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个人博客: xuzhougeng.top (随缘访问)
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苦逼的科研狗<br>记性不好所以一些东西就写下来加深印象，正好分享给一些需要的朋友
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Linux-安装stringr时报错（conda安装，已解决！）
一、mobaxterm镜像选择未弹出 二、安装stringr包失败 之前在本机的Rstudio安装stringr的时候好像没有出现什么问题今天试着在实验室的服务器上安装str...
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你好，请问提取cds的时候报错，这种情况怎么办呢？
No fasta index found for FF.fasta. Rebuilding, please wait..
Fasta index rebuilt.
生成的Epel.fasta.fai有什么用呢？之后cds要怎么提取嘞？谢谢gffread使用小妙招
大家好，今天给大家分享一个软件(cufflinks)中的一个命令gffread，前一段时间需要提取生菜所有基因的CDS序列，本来一开始准备自己写脚本，后来发现gffread就...
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你好，请问提取cds的时候报错，这种情况怎么办呢？
No fasta index found for FF.fasta. Rebuilding, please wait..
Fasta index rebuilt.2022-11-22教你如何使用gffread软件
一、获取软件1、利用conda，简单快捷 2、下载安装这里用到了gffread (https://github.com/gpertea/gffread[https://git...
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博主您好 运行脚本一之后 报错如下 之后要怎么办呢？
Can't locate Bio/Root/RootI.pm in @INC (@INC contains: /usr/local/lib64/perl5 /usr/local/share/perl5 /usr/lib64/perl5/vendor_perl /usr/share/perl5/vendor_perl /usr/lib64/perl5 /usr/share/perl5 .) at bp_genebank2gff3.pl line 203.
BEGIN failed--compilation aborted at bp_genebank2gff3.pl line 203.【脚本搬运工】convert gbff to gff/fasta
写在前面从NCBI下载的注释文件通常是gbff格式的，而我们平时做上游分析用到的大多数为gff或gtf文件，那么这两种格式之间怎么进行转换呢。一番搜索后得到如下perl脚本。...
