什么是富集分析？ 当我们获得了一批生物数据时，例如转录组的数据，蛋白质组的数据，其中必然要做不同样本之间的差异基因分析这一步，例如空白对照组与实验组的差异基因或蛋白分析。在得...
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GO注释和富集分析概念介绍
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R-如何在图表左侧的pheatmap中显示行名？问题 我正在使用R中的pheatmap包制作热图。默认情况下，行名显示在热图的右侧。有谁知道如何将它们移到左侧？ 其他一些软件包似乎对此具有功能，例如row_names_si...
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R语言绘制精美图形 | 火山图 | 学习笔记一边学习，一边总结，一边分享！ 教程图形 前言 最近的事情较多，教程更新实在是跟不上，主要原因是自己没有太多时间来学习和整理相关的内容。一般在下半年基本都是非常忙，所有一个人...
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2021-01-05ComplexHeatmap热图R包参数解读
之前画热图一直在用pheatmap,简单美观，但是后面有了些特殊需求之后,人就不知足了，所以转到了功能更全面但是相对更难入手的 ComplexHeatmap[http://w...
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用pheatmap画热图
假装是前言 学了很久的R，一直也没啥进展，之前一直觉得R不是很容易的东西吗，复制粘贴代码就好了。。emmm，太年轻太年轻。。 我用R的日常就是画热图，各种各样的热图。所以网上...
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热图去掉聚类树但是保留聚类
看到这个问题，你可能搜了好多答案，比如 热图如何去掉聚类树的同时保留聚类的顺序？ - 简书 (jianshu.com)[https://www.jianshu.com/p/e...
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【R画图学习9.1】双向柱状图这个系列开始，学习一下柱状图的一些技巧。普通的柱状图，在做GO/Pathway富集分析的时候测试过了。命令也很简单，就是ggplot()+geom_bar()就可以实现了。我...
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biomart如何调用特定版本的数据库进行注释及ID转换
调用特定版本的BioMart database 在R中安装biomart 大家一般用biomart对id进行转换，或者加上其他注释信息，比如gene type等等但是一直存在...
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