作者，Evil Genius Atera已经上线一段时间了，手上开始有Atera的分析项目了，先给大家分享一点初步的分析经验，如果想完全掌握Atera的数据分析，还需要一点时...
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Atera项目分析--稀有细胞类型的注释与CNV分析的提升 -
文献分享（visium HD + xenium）--空间组学解析神经母细胞瘤中的肾上腺素能（ADRN）和间充质（MES）细胞状态作者，Evil Genius 今日我们分享文献，分享文献最直观的好处就是，做PPT的时候有大量的素材和出处。 核心问题：神经母细胞瘤患者肿瘤中是否存在恶性间充质（MES）肿瘤...
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顶刊分享（xenium 5k）--肺癌拦截的浸润前调节性T细胞轴作者，Evil Genius 新的技术容易发现新的现象，更容易发好的文章，那如果技术成熟了呢？比如单细胞空间，技术成熟了以后，就要求大家垂直的高度了，大家自身的感觉就是，越来...
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文献分享（visium HD）--空间转录组学揭示骨关节炎软骨下骨微环境异质性作者，Evil Genius AI时代，大家要学会拥抱这种新变化，但是切记工具只是工具，更重要的是要强化自身。 今日我们分享文献 摘要 尽管越来越多的证据表明软骨下骨改变与骨...
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顶刊分享（visium HD & xenium）--人类心脏发生动力学及其在21三体综合征中的破坏作者，Evil Genius AI现在可以总结文献，但是如果大家直接AI总结文章来看，相当于囫囵吞枣，科研细节决定成败的案例比比皆是，大家还是要看原文，加上自己的理解，不要看...
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文献分享（SeekSpace + visium HD + xenium 5k）--多平台单细胞和空间转录组学揭示男性乳腺癌的性别特异性恶性状态和结构作者，Evil Genius 工作第一天，先看邮件箱。 基本上大家发文章，审稿人都会给一大堆审稿意见，我们需要一一修改回复，甚至文章需要大改，这个过程是最难熬的过程，也是离曙...
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文献分享--γδ T细胞调节小细胞肺癌的抗肿瘤免疫作者，Evil Genius 国庆假期马上结束了，大家做好搬砖的准备了么？ 今日我们分享文献 Graphical Abstract Infiltration of γδ T ...
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文献分享--PD-1阻断后肿瘤浸润浆细胞谱分析揭示肿瘤特异性抗体作者，Evil Genius 大家平时有空多看看文献，看看最前沿都在干什么，以及有什么突破的医疗技术。 今日分享文献，现在真的是得多组学得天下。 Graphical Abst...
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文献分享--人类面部多样性背后的细胞类型和调控元件图谱作者，Evil Genius 今日我们分享文献，看来想发点好的文章，多组学是必然。 摘要 人类遗传多样性产生了惊人的面部形状多样性，而颅面畸形是最常见的出生缺陷之一。识别介导...
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顶刊分享（xenium）--跨脑部疾病的转录组脆弱性单细胞图谱作者，Evil Genius 今天我们分享文献 摘要 神经退行性和神经精神疾病给社会带来了巨大的公共卫生负担。然而，对这些高度复杂病症的分子机制的理解仍然有限。为了深入洞察不...
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文献分享（xenium 5k）--跨物种单细胞肾脏表观基因组图谱揭示疾病中以上皮为主的衰老样状态作者，Evil Genius 国庆期间，大家可以好好休息一下，放松心情再出发，或许现在正在经历一些不好的事情，但一定都会过去。 今天我们分享文献，多组学的研究，这也是必然的趋...
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文献分享（xenium）--组织驻留巨噬细胞转移硒转运蛋白保护胰腺癌免于铁死亡作者，Evil Genius 今天我们分享文献，一篇cell在手，晋升几乎畅通无阻，也说明了多组学是必然的趋势。 摘要 胰腺导管腺癌（PDAC）是一种侵袭性癌症，预后不良，其...
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方法分享--ResolVI：解决空间转录组学中的噪声与偏差作者，Evil Genius 祝大家国庆快乐。 今日我们分享文献 摘要 在完整组织切片中、以高空间分辨率、高通量估计RNA表达的技术（空间转录组学）为细胞如何通讯以及组织如何...
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课程补充--分子动力学模拟的过程中添加辅酶、金属离子等内容作者，Evil Genius 我们2026的课程，这就算结束了，包括两部分。 针对空间转录组的在2026年空间转录组系列课程[https://mp.weixin.qq.com...
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文献分享（xenium）--肝内胆管癌三级淋巴结构异质性的时空图谱塑造免疫生态位与临床结局作者，Evil Genius 马上国庆了，祝大家国庆节快乐，好好玩一玩。 今日我们分享文献 摘要 肝内胆管癌（iCCA）是一种高度致命的恶性肿瘤，治疗选择有限。iCCA中三级...
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课后补充--先导化合物的优化策略作者，Evil Genius 世事无常，红白事接踵而至，看着父母这一代开始有人陆续下车了，心里总是有一种说不出来的感伤。 现实其实也是很多磨难，大家如果选择回到家乡，就要接受...
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文献分享（xenium 5k）--单细胞与空间多组学揭示多药耐药中肿瘤-基质界面的复发性多细胞生态位作者，Evil Genius 今天我们分享文献 摘要 多药耐药（MDR）是癌症治疗几乎不可避免的终点，驱动肿瘤快速进展，然而其演化逻辑仍不清楚，因为MDR肿瘤很少被切除。本研...
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课后补充--RFdiffusion + ProteinMPNN从头抗体设计作者，Evil Genius 今天我们来梳理一下从头抗体设计的思路。 一、RFdiffusion从头设计抗体：完整路线 二、第一步：准备靶蛋白结构 假设已经有： 首先进行结构...
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课后补充--靶蛋白抗体设计思路作者，Evil Genius 只要大家坚持不下桌，轮也该轮到我们了。 今天我们来补充靶蛋白抗体设计的一些内容。 如果靶蛋白三维结构已经知道，设计能够特异性结合它的抗体，本质上...