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课前准备--visium HD的课题分析思路 -
课前准备--肿瘤细胞邻域分类作者，Evil Genius 2026的培训这就打算开始了，报名链接在2026年空间转录组系列课程[https://mp.weixin.qq.com/s/AFW4J7S-RS...
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课前准备--bin模式下HD（Stereo-seq）注释的double模式与细胞niche作者,Evil Genius 2026的培训这就打算开始了，报名链接在2026年空间转录组系列课程[https://mp.weixin.qq.com/s/AFW4J7S-RS...
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2026年空间转录组系列课程
作者，Evil Genius 2026年的培训马上就要开始了~~~~ 课表如下： 第一课：10X visium基础分析与多样本整合 第二课：10X visium空间注释与单细...
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课前准备--单细胞空间药理学作者，Evil Genius 高考了，翻开自己18岁的照片，真的是时光荏苒，从青葱少年变成现在的油腻大叔了，大家当初的梦想都实现了么？ AI与多组学，大家准备好了么？ 这一篇...
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课前准备--肿瘤微环境 9 大功能生态位详细汇总作者，Evil Genius 这一篇我们主要来汇总一些常见空间生态位。 其中主流的空转平台 常用的就是visium、visium HD、Xenium、CosMx、Stereo...
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CosMx文献分享--通过单细胞空间分析对携带罕见可操作突变的肺腺癌实施分层，并解析其免疫调节相关的细胞间交互作用作者，Evil Genius 大家对即将到来的AI与多组学，做好准备了么? 基因组、单细胞空间、分子对接/分子动力学、宏基因组等，以后必将作为一个整体进行分析。 怪不得公司都...
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课前准备--分子niche和细胞niche的联合使用
作者，Evil Genius 马上就要高考了，又是一年高考日，又可以坐一坐免费的公交了😄。 今天我们继续汇总思路，分子niche和细胞niche的联合使用 当然，分子nich...
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课前准备--目标细胞的邻域分析作者，Evil Genius 今天我们需要梳理一个分析点：目标细胞的邻域。 无论对于低精度还是高精度，邻域分析都是核心和重点，但是想要分析到这个地方，前面有很多工作要做。 对...
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CosMx文献分享--结直肠癌中KRAS抑制剂并发性遗传与非遗传耐药机制作者，Evil Genius 大家不要以为基础分析很简单，大家先看下面 技术平台样本类型推荐切片厚度XeniumFFPE (石蜡切片)5 µmFresh Frozen (新鲜...
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课前准备--高精度空转识别与疾病相关细胞-细胞相互作用作者，Evil Genius 技术的发展总是很快，马上Atera就要出了，大家敢做第一批吃螃蟹的人么？ 今天我们要更新脚本，关于高精度分析通讯的策略问题。 之前的分享，低精度...
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分子对接--3维构象定量关系（3D-QSAR）作者，Evil Genius 5月最后一天了，我们来完成分子对接的最后一块拼图，3维构象定量关系。 3D-QSAR核心目的是研究分子的三维结构与其生物活性之间的定量关系，从而...
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顶刊分享（visium HD）--利用CRISPR筛选测序揭示空间分辨的功能基因组学作者，Evil Genius 到这一篇，我所搜集的关于visium HD实验类文章已经达到50篇了，大家做了HD的要加油赶紧发文章了。 今天我们分享文献，文章的核心目的：将基...
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分子动力学--分析结果的详细解读作者，Evil Genius 这一篇我们来详细解读分子动力学最后的分析结果。 首先第一个：RMSD--用于量化分子结构的变化程度或差异大小。 RMSD的定义：均方根偏差计算的...
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课前准备--低精度（visium）百分比矩阵矫正与细胞niche分析作者，Evil Genius 针对低精度的visium数据，大家分析细胞niche的结果还好么？ 随着分析的深入，大家还可以自我设置niche参数人为定义么？ 对不起，大概率...
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计算机辅助药物设计的流程梳理作者，Evil Genius 整理了分子对接和分子动力学，我们来梳理一下计算机辅助药物设计的流程。 小分子药物设计是一个快速发展的领域，它具有革新新药物开发的潜力。随着结构生...
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visium HD & 分子动力学--内皮SMAD1-MCAM轴通过LAMB1-ITGB1信号通路促进舒尼替尼耐药及透明细胞肾细胞癌的进展作者，Evil Genius 大家能接受自己是同学中混得最差的么？大家愿意接受自己的人生算失败么？ 命运这种事，真的让人难以捉摸，起起落落。 山西长治市沁源县5月22号煤矿瓦...
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Stereo-seq & 分子动力学--内吞逃逸导致癌症对抗体药物偶联物疗法产生耐药性作者，Evil Genius Ai与多组学的结合，现在发展的速度越来越快了。 今天我们分享文献，Stereo-seq & 分子动力学。 知识积累 Enfortumab ved...
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分子动力学--结合自由能的计算作者，Evil Genius 这一篇我们继续分子动力学。 以前高中不知道学的那些东西有什么用，现在多多少少知道一些了，生物这个学科，必须交叉，生物物理、生物化学、计算生物学、...