作者，Evil Genius 马上Atera要出了，大家测了xenium 5k的分析效果还好么？ 大家能区别分子niche + 细胞niche的区别，以及如何对两者进行联合分...
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课前准备--Xenium 5k文献汇总 -
课前准备（Xenium 5k）--人和小鼠肺腺癌前体细胞的空间及多组学分析揭示TIM-3是癌前病变干预的潜在靶点作者，Evil Genius 我们2026空间转录组系列课程[https://mp.weixin.qq.com/s/AFW4J7S-RSp0DKtKfXGIWA]进入到xen...
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2026第十七课脚本更新--visium HD（Stereo-seq）空间邻域通讯作者，Evil Genius 2026空间转录组系列课程[https://mp.weixin.qq.com/s/AFW4J7S-RSp0DKtKfXGIWA]本周我们进入到x...
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课前准备（Stereo-seq）--PD-1阻断可解除局部乙型肝炎病毒相关B细胞应答对肝细胞癌的抑制作用作者，Evil Genius 分子对接/分子动力学，CADD计算机辅助药物设计，做了一个合集，分子动力学[https://mp.weixin.qq.com/mp/appmsg...
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内容汇总--CD8+ T细胞肿瘤浸润的屏障、机制与治疗机遇作者，Evil Genius 生物信息分析，信息很重要，生物学解读更重要，所以要不断地丰富知识体系。 今日参考文章 知识积累 免疫细胞向肿瘤的动态浸润是癌症免疫学的基石，也是...
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课前准备--空间多组学免疫衰老图谱揭示人类淋巴结中生发中心B细胞功能障碍作者，Evil Genius 分子对接/分子动力学，CADD计算机辅助药物设计，做了一个合集，分子动力学[https://mp.weixin.qq.com/mp/appmsg...
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课前准备--GABA 促进 TLS 阳性肿瘤患者对免疫治疗的耐药性作者，Evil Genius 2026年空间转录组系列课程[https://mp.weixin.qq.com/s/AFW4J7S-RSp0DKtKfXGIWA]过半，各位学员...
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课程补充--关于visium HD（Stereo-seq）scNiche与COMMOT的运用作者，Evil Genius 关于visium HD（Stereo-seq），可能基因检测数量偏低，但是胜在数量多，好好挖掘还是可以做出很多有意义的内容。 我们2026年空间...
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第十四课代码更新--visium HD（Stereo-seq）不同条件下niche的比较分析作者，Evil Genius 大家还记得空间样本比较不同niche从哪几个角度入手么？参加2026年空间转录组系列课程[https://mp.weixin.qq.com/s/...
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课前准备--visium HD（Stereo-seq）空间临近性分析作者，Evil Genius 这一篇我们来更新代码，实现下面的结果。 关于visium HD（Stereo-seq），在细胞分割上与xenium、CosMx仍然存在差距，所以...
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课前准备（visium HD）--结直肠癌宏观与微观转移的空间多组学景观作者，Evil Genius 现在的天气真的是太热了。 大家如果有能力，最好掌握基因组 + 单细胞空间 + 分子对接/分子动力学，基因组 + 单细胞空间在于发现生物学问题，...
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分子对接结果的Protein-Ligand Interaction Profiler作者，Evil Genius 今天给大家介绍一个网站，PLIP - Welcome[https://plip-tool.biotec.tu-dresden.de/plip-w...
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第十二课代码更新--visium HD（Stereo-seq）多样本banksy + harmony整合分析分子niche作者，Evil Genius 学习这件事，大家能坚持多久就坚持多久，而且学习是成本最低的。 我们2026空间转录组系列课程[https://mp.weixin.qq.com/...
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代码更新--bansky + harmony多样本高精度整合（visium HD）作者，Evil Genius 多样本整合就是要在同一水平下比较多个样本。 visium HD可以依据细胞分割的结果直接整合么？有时候可以。 可以的条件是大家visium HD...
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课前准备--通用-专用AI框架，用于空间分析流程中的感兴趣区域（ROI）选择作者，Evil Genius 大家一定要珍惜学生时代，尤其硕士博士阶段，对于生物学、医学方向而言，一篇好的文章意味着什么，我相信大家比我更深有体会。 学生时代年轻，有精力，只...
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课前准备--空间转录组学分析揭示小鼠和人类中独特的红系造血niche作者，Evil Genius 大家的visium HD（Stereo-seq）数据分析还好么？2026空间转录组系列课程[https://mp.weixin.qq.com/s...
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脚本更新--10X visium细胞共定位与临近性分析作者，Evil Genius 这一节课我们来更新第六节课的代码。 大家要注意，“共定位”不完全等于“细胞互作”（Cell-cell Interaction）。共定位是互作发生...
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2026第九课代码更新--10X visium文献绘图补充作者，Evil Genius 我们2026空间转录组系列课程[https://mp.weixin.qq.com/s/AFW4J7S-RSp0DKtKfXGIWA]低精度10X...
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课前准备--头颈癌中，空间定义的微环境生态位与临床结局及肿瘤生态系统多样性相关作者，Evil Genius 300万字已到，可能就不能天天给大家分享内容了。 粉丝不多，见笑见笑，纯科研号，没有任何营销，当然也没啥收益。 在我们2026空间转录组系列课程...
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文献分享（visium HD）--空间分子图谱揭示人类伏隔核中异质性细胞类型的解剖学组织作者，Evil Genius 好几个粉丝问我这个单细胞空间交响乐[https://mp.weixin.qq.com/s/AFW4J7S-RSp0DKtKfXGIWA]的号粉丝...