今天还是在做张阿姨的项目，还是那100多个菌，她说要blast一下抗性基因，那就比咯，最出名与权威的的细菌抗性基因库自然肯定是resfinder了。 写个循环，刷刷弄完真开心...
发简信
IP属地：辽宁
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超简单python脚本实现从resfinder+blast下机数据到csv抗性基因矩阵 -
2022-05-24如何设计QPCR引物本教程是利用NCBI数据库进行设计。https://www.ncbi.nlm.nih.gov/[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/]第一步：准备所要设...
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[ZT] 常用在线序列比对工具文章来源：企鹅号 - 卡嘿哟 从早期序列比对工具Needleman-Wunsch、Smith-Waterman到后来的Clustal算法，以及近几年的Muscle、MAFFT...
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@shenghuanjing 好滴好滴 十分感谢🙏
使用Snippy构建细菌基因组SNP、core SNP和系统进化分析
snippy[https://github.com/tseemann/snippy] 是澳大利亚墨尔本大学的 Torsten Seemann[https://twitter....
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@shenghuanjing Checking version: snpEff -version is >= 4.3 - ok, have 5.0 您好 我的版本是5.0诶 好像也不太可以😭
使用Snippy构建细菌基因组SNP、core SNP和系统进化分析
snippy[https://github.com/tseemann/snippy] 是澳大利亚墨尔本大学的 Torsten Seemann[https://twitter....
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@shenghuanjing 这样的
ERROR: Could not find .aligned.fa/.vcf in 120121使用Snippy构建细菌基因组SNP、core SNP和系统进化分析
snippy[https://github.com/tseemann/snippy] 是澳大利亚墨尔本大学的 Torsten Seemann[https://twitter....
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ERROR: Could not find .aligned.fa/.vcf in 120121
使用Snippy构建细菌基因组SNP、core SNP和系统进化分析
snippy[https://github.com/tseemann/snippy] 是澳大利亚墨尔本大学的 Torsten Seemann[https://twitter....
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@shenghuanjing VScode上的服务器 CentOS
使用Snippy构建细菌基因组SNP、core SNP和系统进化分析
snippy[https://github.com/tseemann/snippy] 是澳大利亚墨尔本大学的 Torsten Seemann[https://twitter....
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@e7e5693cfe90 您好，我也遇到了一样的报错，请问解决了嘛😭
我的SNP calling和核心SNP(core SNP)聚类分析流程
个人进行SNP分析用的软件是snippy[https://github.com/tseemann/snippy]，主要是可以一次批量完成。准备工作：1.待分析的序列文件（fa...
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男，某西北高校博士在读，摸鱼专业户。
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您好 请教一下,生成.sh文件后没办法运行sh文件，没有输出core.cln 是为什么呀😭
使用Snippy构建细菌基因组SNP、core SNP和系统进化分析
snippy[https://github.com/tseemann/snippy] 是澳大利亚墨尔本大学的 Torsten Seemann[https://twitter....
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您好 运行.sh脚本时一直报错为什么 命令行 sh snippy.sh
八. SNP检测和进化分析（Snippy）
一. 简介 Snippy[https://github.com/tseemann/snippy]是一款用于SNP检测的软件，可以通过分析得到核心SNP，进行比对构建进化树。 ...
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你好，想请教一下 multi报错，unreadable file是什么原因呀
我的SNP calling和核心SNP(core SNP)聚类分析流程
个人进行SNP分析用的软件是snippy[https://github.com/tseemann/snippy]，主要是可以一次批量完成。准备工作：1.待分析的序列文件（fa...
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检测snp和InDel的工具：snippy~可用于检测两条fasta序列之间的变异生成vcf格式文件这个软件的github主页 https://github.com/tseemann/snippy[https://github.com/tseemann/snippy] 我是...
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不做无条件咨询，见谅
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在写了（行数1，字数0）。
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2019.8月中旬开始系统自学生信，<br>自学路漫漫索性报个班。<br><br>生信技能树真的很棒！<br><br>这是我的一个学习笔记平台，点滴记录。
