FIMO官网教程 官网：这里[http://meme-suite.org/doc/fimo-tutorial.html?man_type=web] （一）什么FIMO？ FI...
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Motif scanning tool: FIMO（在线版分析笔记） -
集群任务管理系统SGE的简明教程
我用的一个服务器上装了一个集群管理工具(SGE, Sun Grid Engine), 用于从登陆节点上向计算节点进行任务投递。一开始，不太会用，但是经过一段时间的摸索学习后，...
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hyphy计算选择压力(+pal2nal的使用)官网：http://www.hyphy.org/[http://www.hyphy.org/]http://www.bork.embl.de/pal2nal/[http://...
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Hyphy，不亚于Paml的选择压力分析的优秀软件，使用指北
近几年来，Hyphy的使用人数越来越来多，虽然不及paml，但这款软件的一些优秀特性使得它值得受到使用和关注。首先相比paml，hyphy有以下几大优点： 操作使用简单。 运...
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零基础快速完成基因功能注释 / GO / KEGG / PFAM...写在前面 早前已经推过《新手eggNOG-Mapper详细教程》，但仍然有很多人遇到使用问题。换句话，可能那个教程不能彻底解决大伙遇到的问题。于是我决定写一个完美的教程，彻底...
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用PLAM下的mcmctree做分歧时间估计
用mcmctree做分歧时间估计的时候遇到报错： 问题是序列不符合phylip格式，每个名字没有区分开 1.使用以下命令行将orthofinder处理好的多序列比对结果，fa...
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一个简易版提取最长转录本的方法根据gff和基因组文件提取最长转录本有很多工具，但发现没有一个适合我的，因为那些工具有各种输入文件限制，例如GetTransTool[https://pypi.org/pro...
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贴心 | GXF Fix 修复 / 优化基因结构注释信息文件 - GTF/GFF3写在前面 目前基因组测序和组装成本几乎已经到任何一个课题组都可以单独负担的价码，大量物种的基因组序列被测定和释放。与此同时，对应的基因结构注释信息文件，如GTF或GFF3文件...
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「基因组」日常工作之修改注释文件和NCBI基因组下载
只想水一水，我某一天水别人的东西。今天，看了半个小时的nextdenovo组装 segmentation fault 报错异常，终于从github上的回复看到了解决思路，老...
