那请教一下，FPKM的差异基因分析可以用edgeR么
理论 | 简述RPKM，FPKM，TPM在高通量测序数据的分析中，仅仅靠raw read counts描述基因的表达量是远远不够的。受限于测序过程中的技术因素影响，read counts对于基因表达量的反映存在一定...
IP属地：上海
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WGCNA:加权基因共表达网络分析
加权基因表达网络分析（Weighted gene co-expression network analysis, WGCNA），又叫权重基因共表达网络分析，其根本思想是根据基...
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常用生物信息学格式介绍(fasta、fastq、gff2、gtf(gff2.5)、gff3、bed、sam、bam、vcf)前言 在各个行业都是有行业标准的，这样才能统一规范而方便后面的分析，在生物信息学领域中主要是各种大量序列数据、注释数据等，这些都是有特定的格式去表示，下面列举几种常见的格式。...
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CeRNA才是人生赢家，一篇著名的赤果果的文(tao)献(lu)ceRNA是个啥？ 首先肯定要先搞清楚ceRNA是个啥，英文名competing endogenous RNAs，咱给翻译成——竞争性内源RNA。其实简单去理解只要理解一个核...
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3.转录组 | 富集分析（clusterProfiler）基因富集分析 (gene set enrichment analysis)：在一组基因或蛋白中找到过表达的基因或蛋白。 常用的注释数据库：①GO( The Gene Onto...
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加权基因共表达网络（WGCNA）寻找与疾病相关的hub基因WGCNA其译为加权基因共表达网络分析。该分析方法旨在寻找协同表达的基因模块(module)，并探索基因网络与关注的表型之间的关联，以及网络中的核心基因。适用于复杂的数据模式...
