写在前面 最近可能是不少人要赶毕业论文，于是找上了 TBtools，并急急忙忙希望解决自己的问题。于是，他们总是会在群里 @我 或者 @管理员。事实上，这是一个违背群约定的事...
发简信
IP属地：澳门
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TBtools | 开箱须知 -
@斩毛毛 多物种就要选前景枝和背景枝吧，打个比方，1物种和2物种是聚在一起的，3物种是聚在大枝的，那结果里也会有1物种和3物种的基因对的结果吗
paml计算 KaKs值
此前介绍利用Kaks_calculator计算ka/ks 值，本次对paml 进行计算kaks做一简单介绍。 软件安装 PAML 可实现系统发育树的构建，祖先序列估计,进化模...
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BLAST（2.12.0+）使用记录文章仅是记录自己的学习使用，有错误请指出，我立刻改正！ 官方说明：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK279684/#appendic...
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@GaGaLab 是我搞错了，放到Rstudio里面运行，就有结果生成了。谢谢回信。
RSEM的TPM,FPKM,COUNT数据整合
RSEM的数据整合只能整合count内容所以简单写了个函数整合RSEM的TPM,FPKM,COUNT
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@GaGaLab 我生成的是样本名称，大佬是这样的吗
RSEM的TPM,FPKM,COUNT数据整合
RSEM的数据整合只能整合count内容所以简单写了个函数整合RSEM的TPM,FPKM,COUNT
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随笔 | 「生物软件开发」一把死锁
「生物信息」概念被提出已有许多年，可以说比我年龄大了许多。但到底是什么，不同人有不同定义。尤其自高通量测序出现，对于生物信息来说，有一大波变化。而我时常与相似背景的朋友提及，...
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ggplot2画富集分析图，带缩短文本长度今天骨科一位学生问我他在做富集分析的时候，得到的文字太长了，如何让文字分开的问题，其实富集分析经常会得到一些结果的标题很长很长，不管是barplot还是dotplot都会出现...
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@tttxd 那就一个一个来吧，速度应该也挺快的吧，我也只试过一个物种的
寻找R gene三种方法之RGAugury
特别感谢卖萌哥[https://www.jianshu.com/u/77fc519c6fa2]对于R gene的资源分享和指导帮助 参考文献：RGAugury: a pipe...
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用TBtools，快速高效实现基因组共线性分析与可视化， 赞！写在前面 对于没有做过共线性分析的小伙伴，可以通过以下几段内容，了解一下，我为什么要费劲巴拉画出这样一张图。 除了基因组成的相似性,在不同基因组中基因排列顺序的一致性更能够体...
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1-【antiSMASH_5.2.0】的安装和使用(2021.1.26更新)
安装时间：2021.1.26常用次生代谢产物预测软件：antiSMASH[https://antismash.secondarymetabolites.org/#!/star...
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@32047e0c8ad2 具体从什么版本变更到怎么版本，分享一下吧
寻找R gene三种方法之RGAugury
特别感谢卖萌哥[https://www.jianshu.com/u/77fc519c6fa2]对于R gene的资源分享和指导帮助 参考文献：RGAugury: a pipe...
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想尝试这个数据库，注册了帐号好像需要激活才能使用
【数据库】RxnFinder
由胡春楠老师团队开发的生物合成反应数据库（RxnFinder），这个数据库由专门的公司团队在维护更新。下面是官网介绍： 微生物细胞工厂在生产大宗化学品、天然产品、生物燃料等方...
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@32047e0c8ad2 评论好像不能放图片。如果没报错，按理是不会为0的
寻找R gene三种方法之RGAugury
特别感谢卖萌哥[https://www.jianshu.com/u/77fc519c6fa2]对于R gene的资源分享和指导帮助 参考文献：RGAugury: a pipe...
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插件 | 给一堆「doi」，出一堆「论文.pdf」写在前面 最近给研究生师弟师妹讲一门名为「园艺植物生物信息学实践」的选修课... 计划10~30人，估摸系统出了问题，最终选了 44 人。尽管我尽可能劝退，但仍然有 68+ ...
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🤓还在为批量下文献而发愁吗，来tbtools
插件 | 给一堆「doi」，出一堆「论文.pdf」
写在前面 最近给研究生师弟师妹讲一门名为「园艺植物生物信息学实践」的选修课... 计划10~30人，估摸系统出了问题，最终选了 44 人。尽管我尽可能劝退，但仍然有 68+ ...
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如何在IGV上使用BLAT搜索非模式物种IGV提供了BLAT，用于进行序列搜索，但可惜我一直用不上，因为它默认是调用了UCSC的CGI工具，将我们的输入序列发送到https://genome.ucsc.edu/cg...
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今天刚搜过，今天就出现了👏
神器！| 加速访问 github ，加速你的科研
写在前面 目前，github 应是生信软件摆放的主流仓库。比如我们熟悉的TBtools， Seqkit，IGV等等。当然，甚至很多时候，我们会发现一些高水平的分析类文章直接讲...
