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收录了6篇文章 · 3人关注
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    用Beagle做基因型填充(Imputation)

    在学习基因型填充之前需要了解一下什么是Phasing(基因定相、单倍体分型),主要是参考公众号碱基矿工中的一篇文章:人类基因组的Phasing原...

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    我的GWAS学习笔记

    上个月中旬,出于对GWAS的好奇,我参加了一个培训班,之后又花了一周的时间来整理听课笔记,感觉现在对GWAS已经有了一个比较全面的认识。 在ca...

  • 群体遗传中基于SNP的PCA分析

    基于群体遗传中变异信息文件VCF来分析PCA 第一种方法 可以使用plink软件直接进行分析 plink --vcf all_genotypeg...

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    群体进化-GWAS分析

    群体进化-gwas分析 群体进化基础分析 PCA 分析原理PCA(Principal Component Analysis),即主成分分...

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    somatic和germline突变

    somatic突变是体细胞突变。主要侧重比较的是正常组织和患病组织的体细胞突变。体细胞在复制的过程中,发生了突变,导致这种体细胞突变。更偏重于单...

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    SNP功能注释网站合集

    这篇文章是对SNP位点功能注释在线网站的一个总结帖。 软件排名不分先后,优先顺序可以看推荐指数。 彩蛋在最后,请坚持看完 1、GWAS4D, 推...

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