有效降维对于scRNA-seq分析至关重要。主成分分析（PCA）被广泛使用，但需要连续的、正态分布的数据；因此，它经常与scRNA-seq应用中...
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Nature子刊 | 将对应分析（CA）应用于scRNA-seq数据的降维、批量整合和可视化 -
Sincast：利用bulk RNAseq定义细胞功能亚群前言 说到对单细胞亚群进行定义，那对很多分析单细胞数据的小伙伴来说都是最头疼的事情之一了。因为定义细胞的正确与否直接关系到后续分析所有结果的准确...
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单细胞转录组之使用CellChat 对多个数据集细胞通讯进行比较分析1. 数据的准备 2.预测细胞通信 在比较多种生物条件下的细胞-细胞通信时，可以得知细胞通信是否增强；细胞类型显著变化之间的相互作用；不同条件下...
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LIBRA-seq：快速开发单克隆抗体的单细胞技术单细胞测序方法和原理系列： 1. 单细胞转录组建库原理：SMART、TargetAmp和10X genomics[https://www.jia...
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免疫细胞注释-3：B细胞scRNAseq免疫细胞注释： 免疫细胞注释-1：T细胞[https://www.jianshu.com/p/0127c9b380c9] 免疫细...
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单细胞亚群鉴定知多少（一）
作者：尧小飞审稿：童蒙编辑：angelica 引言 随着单细胞技术的发展，获得单细胞数据越来越成为可能，随着单细胞数据的增多，单细胞亚群的鉴定越...
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免疫细胞注释-1：T细胞scRNAseq免疫细胞注释： 免疫细胞注释-1：T细胞[https://www.jianshu.com/p/0127c9b380c9] 免疫细...
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CellRanger原理0. 概述 Cell Ranger 是 10X genomics 官方提供的一套针对单细胞 RNA 测序输出结果进行比对、定量、聚类及基因表达分...
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SingCellaR：一站式解决单细胞数据功能分析前言 Immugent在之前的一篇推文：ProjecTILs：一站式解决肿瘤和感染模型中T细胞的注释[https://mp.weixin.qq....
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使用scanpy进行高可变基因的筛选
作者：童蒙编辑：angelica 代码解读scanpy又来啦，不要错过～～今天我们讲的是：高可变基因的筛选。 函数 scanpy.pp.high...
专题公告
整理收集单细胞相关内容
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