这一篇会在 从零开始学CIRCOS绘制圈图(二)基础上开始在circos绘制基因密度信息。为了保证一致性，可以新建如下几个文件 circos.c...
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从零开始学CIRCOS绘制圈图(三) -
从零开始学CIRCOS绘制圈图(五)这一部分承接 从零开始学CIRCOS绘制圈图(四)，对之前的布局进行调整，使结构更加适合于发表。 染色体的位置顺序 默认情况下是会显示所有的染色...
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从零开始学CIRCOS绘制圈图(四)
通常circos的中间部分不是空白区域，会用一条条线进行连接，表示两个染色体部分区域有关系。 数据格式 对于link，circos要求输入数据至...
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从零开始学CIRCOS绘制圈图(二)在从零开始学Circos绘制圈图（一）我们已经绘制出一个比较丑的circos图，这一部分是讲解一些细节。 这一部分会从上一步的两个文件开始，分别...
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从零开始学Circos绘制圈图（一）一般基因组文章都会有下面这种酷炫图，用来描述基因组的基因密度分布，转座子的密度分布，和其他物种或者多倍体的多套染色体间的共线性关系，以及其他各种...
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序列比对软件 MUMmer 简单上手（一）
MUMmer 4 是一个快速比对 DNA 或蛋白序列的软件，最常用的 program 就是 nucmer 和 promer，分别是比对核苷酸和氨...
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生信 | circos文件准备大全（以拟南芥为例）一、写在前面 扣扣群：559758504（目前无需验证，一键即可加入） 如果你不想学，老板又催着要，你可以加群私聊我寻求帮助( $ _ $ )，...
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【如何拆分多倍体亚基因组？】SubPhaser软件SubPhaser原文链接：https://nph.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/nph.18173[...
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[R]bioconductor之GenomicRanges学习参考资料：https://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/GenomicRanges.h...
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CUT&Tag数据分析笔记（3）这是CUT&Tag数据分析的最后一部分，这一部分基本就是进行各种的可视化了。 第七节 可视化 通常，我们感兴趣的是使用基因组浏览器在各个区域可视...
专题公告
如果二十一世纪是生命科学的时代，那么生物信息一定是二十一世纪的中流砥柱。
虽不是生信专业，但还是得懂一些。
虽很少有时间学，但会一点是一点。
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