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有关calling SVs
收录了8篇文章 · 3人关注
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    VCF变异统计及绘制染色体分布图

    VCF文件的变异分布图，除了使用Circos图之外，统计特定材料间的变异分布情况时可能会用到染色体分布图，为了节省时间，实现统计及绘图的自动化，...

    4.3 生物数据分析笔记 4 35
  • SURVIVOR 合并不同的SV

    SURVIVOR 用于模拟/评估 SV、合并和比较样本内及样本间 SV 的工具集。 githup: https://github.com/fri...

    0.6 斩毛毛 3 7
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    「生信」共线性分析——MCScanX

    目录MCScanX下载及安装数据准备MCScanX运行及结果Ka & Ks 计算下游画图脚本最后 MCScanX有两个主要的功能, 一是, 方便...

    9.8 bioinfo_boy 6 125
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    MUMandCo软件的使用

    写在开头     因为一直在进行call SVs的课题，收集了一些相关软件，今天给各位介绍一款2020年5月份发布的MUMandCo，也可以写作...

    0.6 腐草为嘤 5 9 1
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    应该是最新最详细的MUMmer中文使用说明

    如何使用MUMmer比对大片段序列 测序技术刚开始发展的时候，大家得到的序列都是单个基因的长度，所以一般都是逐个基因的比较，用的都是BLAST或...

    7.3 xuzhougeng 12 84 1
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    参加2019-PGC-XX的些许感想

    前几日随同课题组部分成员一起去参加了第二十届全国植物基因组学大会（PGC-XX）。此次大会邀请了国内外植物基因组学相关领域的近40位报告人，分为...

    0.8 Boer223 2 9
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    【SV分析】01怎么下载物种的contig数据

    因为小编之前做过一段时间的SV分析，所以想在此分享一下做SV分析的过程。 今天先介绍如何下载物种的contig数据？这是SV分析的第一步。 这里...

    0.1 EvoPopGenQ 6 1
  • 【SV分析】02如何使用smartie-sv Calling SV

    上一次小编介绍了如何下载物种的contig数据，没看过的小伙伴可以点击以下链接：https://www.jianshu.com/p/081046...

    0.1 EvoPopGenQ 6 9
  • 【SV分析】03如何安装smartie-sv

    前言 在后台小伙伴的催促下，小Q终于把拖欠了N久的第3篇SV分析--软件安装篇写完了。废话不多说。 内容目录 预安装依赖软件 1.安装Minic...

    0.1 EvoPopGenQ 0 1

专题公告

最近在做用比较两个基因组的方法来call SVs的一些东西，整理资料。