Seqkit是一款专门处理fsata/q序列文件的软件,由go语言编写,功能比较完善,软件使用也很稳定。 优点1.能够非常全面的处理fasta/...
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NCBI中会将测序等数据压缩成sra格式。本文介绍如何批量下载sra文件及转化为Fastq格式。 下载SRA文件sratoolkit 从NCBI...
转录组学习一(软件安装) 转录组学习二(数据下载) 转录组学习三(数据质控) 转录组学习四(参考基因组及gtf注释探究) 转录组学习五(...
全基因组重测序是对已知基因组序列的物种进行不同个体的基因组测序,并在此基础上对个体或群体进行差异性分析。所以首先我们需要某个物种的全基因组序列和...
最近一周开始学习ATAC数据分析,目前只是尝试了简单分析,新手小白,如果有小失误欢迎留言~ 1.准备环境 创建conda环境(如果已有成熟环境不...
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自己在研究生的第一个项目就是处理重测序数据,在做的过程中参考了很多资料,现在把整个重测序的上游分析流程分享给大家,一些关键环节已经帮大家踩过坑了...
刘小泽写于18.7.18表型与基因型相关联(基因定位)是遗传学上的重要问题。 什么是重测序Resequencing? 我们使用的基因组是怎么来的...
一、基本概念 RNA-seq即转录组测序[https://baike.baidu.com/item/%E8%BD%AC%E5%BD%95%E7%...
刘小泽写于2020.2.8大概回顾一下基础知识 一:ORF与CDS ORF:open reading frame(开放阅读框) 它是理论上的蛋白...