目前有多种方法可以进行RNA velocity的分析： scVelo（参考文章：单细胞转录组数据分析|| scVelo 教程：RNA速率分析工具...
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RNA velocity分析练习（一）文件下载以及预处理 -
思路清奇SCI:05.ssGSEA+41条代谢通路PMID: 路线图 结果 1.ssGSEA分析代谢通路+PAM聚类 作者从MSigDB和KEGG收集了41条代谢相关通路，ssGSEA计算各个样...
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一文带你了解单细胞数据基因集打分的所有算法
上一周Immugent写了一篇一文解决单细胞亚群注释的所有问题[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI4MjY...
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irGSEA：基于秩次的单细胞基因集富集分析整合框架（中文教程）一、背景 在单细胞转录组测序中，整合多样本数据进行分析逐渐成为一种趋势。越来越多的研究者趋于使用未校正批次效应后的数据进行差异基因分析。他们认为...
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基于Seurat UAMP和celltype的RNA Velocity速率分析的全套流程参考资料：参考生物技能树[https://mp.weixin.qq.com/s/TJsdj7qesZGlvmEkNLAy0A]Velocyto官...
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单细胞ATAC高级分析
作者：Jenny审稿：童蒙编辑：angelica 前两篇分享(单细胞ATAC概述[https://www.jianshu.com/p/912c8...
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零基础学生信入门笔记(R语言、Linux、Python、RNA-seq、单细胞测序、质谱流式、TCGA、GEO、单细胞经典文献解读)
医学生零基础学生信是先学Python还是先学R语言？[https://www.zhihu.com/question/432353982]如何学习...
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单细胞测序（sc-RNA seq）分析：Seurat4.0系列教程、高级分析、文章复现
时代的洪流奔涌而至，单细胞技术也从旧时王谢堂前燕，飞入寻常百姓家。雪崩的时候，没有一片雪花是无辜的，你我也从素不相识，到被一起卷入单细胞天地。R...
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单细胞时代 || 网络分析应用进展，机遇与挑战前情回顾：单细胞时代 || 细胞身份概念的演变[https://www.jianshu.com/p/c56313177a31]单细胞时代 || ...
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单细胞转录组学生物标志物和靶点挖掘的新方法单细胞转录组学（sc-RNAseq）研究，可以更加有效的解释组织的异质性，从单个细胞分辨率来解释更多bulk水平上难以解释的生物学问题。已经广泛...
专题公告
单细胞
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