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生信之路
收录了10篇文章 · 3人关注
  • 2020-05-11-MSI算法-msisensor计算原理

    MSI msisensor 计算msi原理 MSI突变中重复至少5次的1-5个碱基的序列。然后，使用MSIsensor msi命令，通过使用卡方...

    0.2 Soliva 0 2
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    2020-06-06-驱动基因

    背景 肿瘤基因组学目前面临的挑战之一是将肿瘤形成过程中所涉及的基因组变化（即驱动因素）与对癌细胞没有任何益处的基因组区分开来。癌症形成的过程中驱...

    0.3 Soliva 0 5
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    2020-06-06-T检验-计算TMB两种方式差异

    TMB去除同意突变与非同义突变的差异 取样一组样本去重并且去除不合格样本后剩余427例样本其中同意第一种使用非同义突变计算数据取一个header...

    0.1 Soliva 2 1
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    2020-06-09-FACETS Testing CNV

    FACETS facets is CNV detection software with using the ascn principle in...

    Soliva 0 0
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    2020-05-11Strand bias 链偏好

    Strand bias 链偏好 背景 造成链偏好的原因： 1.Local realignment目的就是将比对到indel附近的reads进行局...

    0.3 Soliva 0 3
  • 2020-01-06 记录自己的沙雕

    手贱 网上搜索了得用U盘重置系统，我尝试过拯救，但是作为一个对linux系统了解不深的人，我表示很无力，因此我考虑了自己的数据后决定重装，对习惯...

    Soliva 0 0
  • IGV截图工具，可自动化

    IGV配置会有些麻烦脚本https://github.com/PdoraB/DiffPdoraBox/blob/master/IGVplot/i...

    Soliva 0 0
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    pheatmap 画NA值热图与 image 画三角统计分析图

    前言：生物信息工作中各种热图层出不穷，介绍两种特殊的热图画法1.含有NA数据的热图 数据格式如上图所示python 中用pandas 处理一下数...

    0.4 Soliva 2 3
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    人工智能or生物信息or科研分析 常用库cheat

    在平时写代码的时候难免会忘一些参数或者功能，总是百度这里提供一些格供给查询 一方面学习，一方面实用 干货！ Jupyter python 编辑...

    1.2 Soliva 4 18
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    R语言 Pheatmap 画非聚类 热图

    python pandas 加 R Pheatmap 画非聚类热图 上面的annotation部分用作临床注释，下面显示Gene 出现的频次。不...

    Soliva 0 5 1

专题公告

生信。计算机。北漂