常用的细胞通讯软件:CellphoneDB[https://www.jianshu.com/p/38a9376f5286]:是公开的人工校正的,...
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1. 细胞周期背景介绍 细胞周期(cell cycle)是指细胞从一次分裂完成开始到下一次分裂结束所经历的全过程,分为间期与分裂期两个阶段。在细...
bioconductor-DropletUtils使用教程:Utilities for handling droplet-based singl...
更好的阅读体验>> 要想在同一页面上排列多个ggplot2图形,基本的R函数par() 和 layout()是无效的。解决方案之一是使用 gri...
双细胞是指由于实验原因,在单细胞微流控等流程中某个液滴中含有2个及以上的细胞,而在同一个液滴中的细胞在后续分析中带有相同的Cell Barcod...
起因:最近有个问题样本,跑完cellranger,样本的cellranger结果如下,细胞数目极高(3W+)。在后续数据质控分析中,线粒体基因占...
在本教程中,我们将学习如何通过一些经典的marker基因计算细胞周期阶段评分,并在预处理过程中将其从scRNA-seq数据中进行回归处理,来减轻...
由于层次聚类的问题(数据量太大的时候,层次聚类的速度很慢,同时会报堆错误,出现内存溢出),inferCNV的不能处理大批量的数据。另外,对于来源...
轨迹分析系列: 单细胞之轨迹分析-1:RNA velocity[https://www.jianshu.com/p/ee0f7a8e6a06] ...
理论知识: 组织是由不同谱系和亚型的细胞类型组成的复杂环境,每种细胞都有自己独特的转录组。因此,批量转录组分析是细胞类型特异性基因表达的总和加权...
专题公告
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