前言 RepeatMasker是一个通过已有数据库预测重复序列的软件,可以筛选DNA序列中的散在重复序列和低复杂序列,是重复序列注释的重要软件。...
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前言 RepeatMasker是一个通过已有数据库预测重复序列的软件,可以筛选DNA序列中的散在重复序列和低复杂序列,是重复序列注释的重要软件。...
一:RepeatMasker安装 在基因组注释中第一步就是重复序列的屏蔽,目前常用的从头注释pipeline就是RepeatModeler + ...
本文方法是根据"Ageing LTR insertions"(https://github.com/SIWLab/Lab_Info/wiki/A...
RepeatModeler已更新,拥有了一些新的功能,可以识别LTR的结构在基因组注释中第一步就是重复序列的屏蔽,目前常用的从头注释pipeli...
今天安装软件时,发生报错,经过查询,可能是之前安装过这个软件,但是不成功,部分文件下载一半就结束了。软件在conda用不了时,可clean一下重...
!!!分享篇使用RepeatModeler2.0+RepeatMasker 的时候,严格按照命令跑程序,出现结果不如我意代码: 出现的结果: 我...
RepeatMasker是重复序列检测的常用工具,通过与参考数据库的相似性比对来准确识别或屏蔽基因组中的重复序列,属于同源预测注释的方式。下文除...
专题公告
重复序列注释