首先附上软件链接:https://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/systemP...
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现在ChIP-seq的数据基本是最常见的测序数据类型之一,主要有Transcription factor ChIP-seq和Histone Ch...
SAMBAMBA http://lomereiter.github.io/sambamba/ 一、安装 (支持mac OS/linux 64位)...
开篇致谢:下面内容的整个框架是跟着生信技能树发布在bilibili上的ChIP-seq视频学习的,链接:https://www.bilibili...
之前写过ChIP-seq的基础分析:ChIP-seq数据分析(一):从raw reads到peaks,和此文有很多相似之处。 简介 ATAC-s...
学习目标: 学会用MACS2 call peaks 理解MACS2 call peaks的结果 Peak Calling Peak callin...
今天介绍和测试这款关联ChIP-seq、RNA-seq分析软件,BETA(Binding and Expression Target Analy...
背景: 染色质和染色体的结构和功能 每一条染色单体由单个线性DNA分子组成。细胞核中的DNA是经过高度有序的包装,否则就是一团乱麻,不利于DNA...
参考生信技能树1以及生信技能树2只记录从数据下载,到最终结果展示,具体生物学知识请自行查阅稍后关于ChIP-seq的背景知识我会再发布一篇文章。...
放在最前面的参考链接:给学徒的ATAC-seq数据实战(附上收费视频) 数据来源的文章: The landscape of accessible...
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