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转录组第五天 -
转录组day4转录组
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生信星球转录组培训第一期Day5--善良土豆DAY5学习内容：过滤和比对 过滤 通过DAY4_fastqc结果，我们开始对数据进行过滤，主要是去除接头和低质量碱基，一般使用两种软件可以完成...
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生信星球转录组培训第一期Day5--郝志刚数据过滤 简介： 目的去掉低质量的碱基或接头，一般使用两款软件：trim_galore和trimmomatic,他们的去除是从不合格的位置往后全...
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生信星球转录组培训第一期Day5——卖萌哥开始忙碌起来，作业可能没法扯那么多闲话了。 数据质控 昨天完成了数据格式的转换，接下来就可以对得到的fastq文件进行处理啦。由于数据的问题，本...
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生信星球转录组培训第一期Day4--善良土豆今天将会用到第二天建立的rnaseq环境及对应文件路径和Day3下载好的.sra数据 今天主要学习内容是配置相关软件环境，开始数据转换，质量控制...
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生信星球转录组培训第一期Day4--郝志刚软件环境 数据转换： 将SRA转变为fq格式。用到软件fastq-dump,它属于sratools工具包中的一个。 数据质控：检测原始数据质量如...
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生信星球转录组培训第一期Day4——卖萌哥
今天开始正式进入RNA-seq分析啦~ 软件安装 由于昨天就已经创建好了新的conda的环境，所以今天只要把用到的软件都装一下就好了。 把要安装...
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生信星球转录组培训第一期Day3——卖萌哥闲言碎语 从今天开始转录组学习进入正题啦。要重现的文章是 RNA-Seq Transcriptome Profiling Identifies ...
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生信星球转录组培训第一期Day3--善良土豆端午安康 今天转录学习第三天，开始进入实战的第一步----数据查找和下载 今天要被自己蠢哭了，自己挖坑自己跳，还给自己埋了2个多小时，真的不夸张...
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