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生信遗忘笔记
9篇文章 · 4746字 · 1人关注
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    circos画图，染色体band参数、着丝粒及间距

    circos一般需要准备circos.conf、ideogram.conf。这里我们添加对染色体bands.conf的配置信息。 细胞遗传学带（...

    1.2 1169 0 2
  • 使用grep命令提取指定基因信息

    准备基因名称信息 编写脚本 没有得到结果文件，使用cat -v 命令查看文件格式，发现结尾有^M的标记 dos2unix是将Windows格式文...

    6.2 1351 1 14 1
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    遗传图谱构建

    遗传图谱产生的背景 20世纪开始现代遗传学进入了一个快速发展的时期，这时人们已经认识到生物性状的遗传由基因决定，而染色体又是作为基因的载体，整体...

    2.6 5031 0 20
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    使用NCBI lifetree 查看所研究物种的分类

    进化树：进化树在生物学中，用来表示 物种 之间的 进化 关系。. 生物分类学家和进化论者根据各类生物间的亲缘关系的远近，把各类生物安置在有分枝的...

    2.1 3243 0 15
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    基因组学总结

    基因组学的定义： 基因组学的目的是对一个生物体所有基因进行集体表征和量化，并研究它们之间的相互关系及对生物体的影响 。基因组学还包括基因组测序...

    4.9 4564 2 32
  • 使用EvidenceModel将基因注释结果合并

    前期可以用cat将几个软件的结果合并进一个文件，这里只用基因预测和转录本预测两个结果： 附件：evm下载包：链接：https://pan.bai...

    1.5 1967 0 13
  • 将测序文件中间文件夹去掉

    拿到公司测序文件后，发现文件夹中间有一个名字没有规律的文件夹，给后面的分析带来了很大的困扰， 使用cp 命令 去掉了中间文件： 接着将测序的双端...

    2.1 299 0 10
  • 使用hisat2+stringtie进行基因预测

    比对到转录本，预测基因 使用TransDecoder将结果整理成evm输入格式 第一步整理后：

    1.4 1470 0 12
  • linux 下实用的文本处理命令

    输出两个文件相同的行：grep -wf 1.txt 2.txt 输出两个文件不同的行：grep -wvf 1.txt 2.txt 找出当前文件下...

    1.7 501 0 12

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