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16篇文章 · 20042字 · 5人关注
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    Fast-Higashi

    摘要 单细胞Hi-C(scHi-C)技术可用于研究单个细胞中的三维(3D)基因组结构。然而,目前的scHi-C分析方法面临着数据质量和复杂的3D...

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    scHiCluster

    scHiCluster 是一个用于单细胞染色体接触数据分析的综合 Python 包。它包括细胞类型(簇)的识别、细胞类型中的循环调用以及单个细胞...

  • 全面分析全局RNA-染色质相互作用的 GRID-seq

    高等真核细胞核中的染色质被各种 RNA 物种广泛结合。最近开发了一种通过固定透化核的深度测序(GRID-seq)原位捕获全局 RNA 与 DNA...

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    CAGE-seq

    [测序原理] CAGE-seq,加帽端mRNA测序,鉴定转录起始位点(TSS) - 知乎 (zhihu.com)[https://zhuanla...

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    DamID-seq(DNA 腺嘌呤甲基转移酶鉴定)

    DNA 腺嘌呤甲基转移酶鉴定(通常简称为 DamID)是一种分子生物学方案,用于绘制真核生物中 DNA 和染色质结合蛋白的结合位点。DamID ...

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    Capture Hi-C和 Promoter Capture Hi-C

    Capture Hi-C Mapping long-range promoter contacts in human cells with hi...

  • 3D基因组名词小记1

    Cis-regulatory elements顺式调控元件(CREs). Non-coding DNA sequences that regul...

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    3D百文8--以碱基对分辨率定义基因组结构

    Defining genome architecture at base-pair resolution | Nature[https://ww...

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    人类染色体

    23对染色体的作用1号染色体,是第一大染色体。包含了高歇病(缺乏脂肪分别酶而致黄疸或贫血)、前列腺癌、青光眼、老人痴智症等病症。 2号染色体,是...

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