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immunedeconv包号称可以利用多种算法进行免疫细胞比例计算,包括quantiseq、timer、cibersort、cibersort_...
immunedeconv这个R包是一个免疫细胞比例估算集大成者,把常见的免疫细胞估算的算法都包括进去了,包括quantiseq、timer、ci...
TCGA风险模型类生信文章中,经常会对高低风险组进行16种免疫细胞和13种免疫功能评分的比较,就会用到一个29个免疫特征的基因集(16种免疫细胞...
TCGAbiolinks包常用来TCGA的下载和各种常用分析,本人在使用TCGAbiolinks下载和整理TCGA临床信息时碰到一些麻烦,具体如...
在前面系列教程中分享了如何下载TCGA表达矩阵(2022新版TCGA数据下载与整理[https://www.jianshu.com/p/9890...
文章参考生信技能树曾老师的帖子:使用ESTIMATE计算肿瘤的免疫得分[https://zhuanlan.zhihu.com/p/1367477...
在TCGA泛癌分析中经常会碰到某个基因与某种肿瘤免疫评分之间的相关性散点图和侧边密度图或云雨图。免疫评分一般用ESTIMATE R包进行计算,这...
在上一篇文章:单基因泛癌表达箱线图和配对箱线图展示[https://www.jianshu.com/p/cda81685fe6f] 中,我们讲解...
单基因泛癌表达箱线图是泛癌分析文章必不可少的一个图,配对箱线图在很多文章中也有出现。本文讲解如何实现单个基因在泛癌表达箱线图和配对箱线图展示。先...
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