在足部诊断治疗过程中，操作时要遵从以下基本原则：
左脚→右脚。
足底→足内侧→足外侧→足背。
反射区的总体顺序是从上至下。
左脚：先心脏、脾脏反射区，五个基本反射区（肾上腺、肾、输尿管、膀胱、尿道），再按反射区分布从上至下的顺序依次操作。
右脚：先肝脏、胆囊反射区，五个基本反射区，再按反射区分布从上至下的顺序依次操作。
全部做完后，再对五个基本反射区进行加强按摩。
足疗顺序的理论依据
先按左脚（心脏、脾脏）的原因。
人体通过循环系统将营养物质和氧气运送到全身，循环介质是血液，心脏是血液循环的动力器官。反射疗法师在反射区进行诊断及治疗时，首先要确定患者心脏的健康程度和承受力，再进行下一步操作。
脾脏是循环系统的主要器官，在血液循环中起到重要的作用，所以在心脏反射区诊断治疗完成后要对脾脏反射区进行操作。
再按五个基本反射区的原因。
泌尿系统负责排泄废物。足部反射治疗会增加血液循环，促进新陈代谢，所以为了防止废物重新进入循环系统，先对泌尿系统的反射区进行按摩操作，有助于废物排出体外。
重复按五个基本反射区的原因。
在足部反射治疗过程中，身体代谢加快，会产生新的代谢废物。再次对泌尿系统进行操作可加强治疗效果，使新产生的代谢废物排出体外。
