数据结构

一、新手必备重点知识（来源：微信公众号生信星球）

（1）R的赋值符号不是等号，而是<-

（2）在Console 控制台输入命令，相当于Linux的命令行

（3）R的代码都是带括号的，括号必须是英文的。

（4）显示工作路径 getwd()

（5）向量是由元素组成的，元素可以是数字或者字符串。

（6）表格在R语言中改名叫数据框^_

（7）别只复制代码，要理解其中的命令、函数的意思。函数或者命令不会用时，除了百度/谷歌搜索以外，用这个命令查看帮助：

?read.table
调出对应的帮助文档，翻到example部分研究一下。

（8）数据类型（重点只有两个，剩下的不看）

向量（vector）👈重要

矩阵（Matrix）

数组（Array）

数据框（Data frame）👈重要

List

part1：向量

二、标量和向量的区分

变量包含标量和向量

1、元素指的是数字或者字符串（用chr表示）等

标量：一个元素组成的变量；

向量：多个元素有序排列组成的变量，一个向量可以作为数据框中的一列。

2、使用前要给变量赋值

如：x<- c(1,2,3) #常用的向量写法，意为将x定义为由元素1，2，3组成的向量。

Tips：

1、重复赋值会覆盖上一次赋值，x的定义以最后一次赋值为准，此时x为1 2 3 1 2 3

2、变量名可以为别的字母

三、从向量中提取元素

1、根据值来提取

x[4] #x第4个元素
x[-4]#排除法，除了第4个元素之外剩余的元素
x[2:4]#第2到4个元素
x[-(2:4)]#除了第2-4个元素
x[c(1,5)] #第1个和第5个元素

1、根据位置来提取

x[x==10]#等于10的元素
x[x<0]
x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c（1，2，5）中的元素

截屏2021-11-20 上午8.48.05.png

Part2：数据框

将示例数据放在工作目录下

一、读取本地数据

1、

读取并将数据赋值给a

用帮助文档查看sep和header的意思

sep：数据的分隔符，

header：预示着文件是否包含变量名称作为第一行的逻辑值

帮助文档

二、设置行名和列名

X<-read.csv('doudou.txt') #在示例数据里有doudou.txt 注意这里的变量X是一个数据框
colnames(X) #查看列名
rownames(X) #查看行名,默认值的行名就是行号，1.2.3.4...
colnames(X)[1]<-"bioplanet"#有的公司返回数据，左上角第一格为空，R会自动补为x,用这个命令来修改
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = " ",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列为行名

注意严格区分字母大小写

三、数据框的导出

write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#分隔符改为逗号，字符串不加双引号（默认格式带由双引号）

已导出数据框

四、变量的保存与重新加载

这次没有处理完的数据可以保存和重新加载。保存的格式是RData。

save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量
save(X,file="test.RData")#保存其中一个变量
load("test.RData")#再次使用RData时的加载命令

工作目录下保存的数据

五、提取元素（来源：微信公众号生信星球）

X[x,y]#第x行第y列
X[x,]#第x行
X[,y]#第y列
X[y] #也是第y列
X[a:b]#第a列到第b列
X[c(a,b)]#第a列和第b列
X$列名#也可以提取列（这个命令不用写括号的地步，并且支持Tab自动补全哦，不过只能提取一列）

六、直接使用数据框中的变量

plot(iris$Sepal.Length,iris$Sepal.Width)

散点图

保存到工作目录下

七、save(X,file="test.RData")这句代码如果报错object X not found

原因可能是文件的路径错了，路径应该放在工作目录下

学习小组Day5笔记-云朵