codna安装报错与写文章暂停了，希望接下来能平衡好，做到日更（加油，以下也主要是借鉴B站天马行空的坦克飞行兵up主的，内容的确很棒）
[if !supportLists]1. [endif]Linux的bashrc文件主要保存个人的一些个性化设置，如命令别名、路径、颜色设置等。下面是个例子： # User specific aliases and functions PATH="/bin:/sbin:/usr/bin:/usr/sbin:/usr/local/bin:/usr/local/sbin" LANG=zh_CN.GBK export PATH LANG alias rm='rm -i' alias ls='/bin/ls -F --color=tty --show-control-chars'例子中定义了路径，语言，命令别名、颜色设置等个性化命令（使用rm删除命令时总是加上-i参数需要用户确认，每次修改.bashrc后，使用source ~/.bashrc（或者 . ~/.bashrc）就可以立刻加载修改后的设置，使之生效。
[if !supportLists]2. [endif]WinSCP将文件在服务器与电脑交叉上传，可以用来处理数据。
[if !supportLists]3. [endif]bin目录放置最常用命令 cd ls rm等命令 Ctrl+L是往下拉（清屏）
[if !supportLists]4. [endif]etc目录是一些配置文件（安装软件需要的配置文件）
[if !supportLists]5. [endif]dev设备缩写，存放服务器外部设备的
[if !supportLists]6. [endif]mnt挂载U盘的，普通用户拷贝数据，插U盘
[if !supportLists]7. [endif]家目录~ 根目录 /
[if !supportLists]8. [endif]base基础环境，启动conda，如果不指定特定环境，则是base基础环境
06 linux新建、复制、移动、重命名、压缩及解压缩文件
mkdir
cat > fafa(编辑模式下建立文本文档，利用alh查看文件属性，d是文件夹，-代表普通文件) cat查看
rm tmp -r 递归删除tmp文件夹
cp bilibili ./bilibili2 -r(复制bilibili文件到当前目录下bilibili2，复制文件夹，需要加-r（需要递归处理）)
mv lj2 ./fiel1（移动lj2这个文件夹到当前目录下的fiel文件）mv fiel1/./yxd（注意移动普通文件与文件夹的区别）
tar -zcvfyxd.gz yxd（压缩中，注意命令的独特性，结果在前，对象在后。理论上应该是把对象压缩成结果，注意独特性）tar +压缩参数选项 +压缩文件 +待压缩文件（压缩）
tar -zxvfyxd.gz -C./myDir(把yxd.gz压缩文件解压到当前文件夹下) tar +解压缩参数选项 +压缩文件 +解压缩地址
注意-C参数的添加（解压缩）
mv的两项功能：移动与重命名 mv lj yxd
07 Linux下安装conda软件（miniconda3）
1wget -c 链接地址（最好镜像是国内的，国内的速度快）(下载文件夹)
2利用bash 命令进行安装（是否接受license，是否同意安装在当前目录（Enter），是否同意初始化设置）
3直接输入软件名或者软件名 -V或者-ｈ，或者切入都可（检查是否安装成功）
4source ~./bashrc（加载其余配置，让安装的软件可以成功启动）
5添加频道（清华4镜像）直接全部粘贴复制
6创建名为rnaseq的conda小环境（可以按照项目去创造，转录组，单细胞转录组等等都可以分别去创造一个小环境）
conda create -n rnaseq
7conda activate rnaseq (激活小环境)
8conda deactivate（通用软件可以放在base环境下，而专门针对RNA seq的就放在RNAseq小环境下，这样安也好安装，删也好删除）
08借助Conda软件安装生物学软件
1安装到小环境下，首先要用Conda激活小环境conda activate rnaseq
[if !supportLists]2. [endif]Conda安装软件 ｃｏｎｄａ ｉｎｓｔａｌｌ ｆａｓｔｑｃ
[if !supportLists]3. [endif]看是否安装成功了（去其相应的环境看安装成功与否 cd rnaseq/）cd biｎ中查找，这个比较麻烦直接conda list就可以完成。
[if !supportLists]4. [endif]同时安装多个环境（最好一个一个安，否则得查看哪个安装成功了，哪个没有）
[if !supportLists]5. [endif]查找某个软件能否用conda安装（1.命令查找conda search软件名；或者mamba search 2. anaconda.org/search网站查找 3.网站搜索bioconda.github.io （可以看依存关系）） 注意软件不兼容问题以及软件依存问题（如必须先安装cutadapt，才能使用tri_galore）
[if !supportLists]6. [endif]指定版本安装conda install trim_galore==0.6.6-1(指定版本安装，必须是两个等于号，表示绝对安装)
3Vim编辑器中，存在几种模式，i与insert可以进入编辑模式，Esc退回普通模式，编辑模式中输入：（英文冒号），可以进入命令模式，q是退出，wq是保存退出。
