写在前面
在「基因差异表达」分析这件事情上,说实话,「TBtools」真的做了不少简化工作,大体如下:
- 做了 Rserver.plugin
- 做了 DESeq2 Wrapper 插件
- 为了确保能去运行,开发了 MetaPackageR 功能
- 为了让一切变得简单,做了 MetaR.plugin 模式,无需再用 MetaPackageR ,用户直接安装对应 R 插件就可以
整完这一系列...新的问题又出现了。大体情况就是:尽管有了示例数据和文件,用户准备起文件,还是会遇到各种各样的问题。
当然,我自己也经常忘了怎么去准备...
于是,干脆写一个简单功能,彻底解决这个事情。
Different Expression Analysis Prepare
这是一个非常简单的功能,打开方式如下
功能窗口只需要设置一个输入,建议使用直接给读段计数的 Raw Counts 矩阵,然后点击 Start
弹出窗口简单
分别对感兴趣的样品进行归组处理
如此重复,可以生成各类自己需要的两两比较组合
简单使用如下
效果就很好
写在最后
有些人想不到,
有些人看不上,
有些人不屑,
而时间,会给出答案。