跨学科学习的基本理念有三：为理解而学、为生活而学、为学科而学。
为理解而学：所谓理解，是将知识运用于新情境以解决新问题的能力。跨学科学习的本质是学生运用多个学科视角即学科关联视角理解世界。学生会因此意识到：同样的问题，同一个世界，可以从多个视角去理解。学生一旦学会运用多个视角看待问题，理解世界，就能更大程度发展理解能力、创造能力。跨学科学习必须在理解中、由于理解并为了理解而开展。
为生活而学：学科源于生活并为了生活。生活具有整体性，解决生活中的问题也往往需要多学科协作。因此，植根于生活的学习必然是跨学科学习。反过来说，真正的跨学科学习必然要建立起学科与生活的内在联系。如果仅仅局限于学科内部，割裂学科与生活的联系，为跨而跨，必然导致跨学科学习的低效。跨学科学习必须在生活中、由于生活并为了生活。
为学科而学科：跨学科学习绝不是为了迎合学生的表面兴趣而牺牲学科逻辑，把几门学科的零散事实拼凑起来而成的。信息时代，只需要某些简单的学科知识和技能就能胜任的工作正在逐步消失，每个人只有至少掌握一门学科，成为这一领域的专家，才有可能幸免被这个世界所抛弃。通过跨学科学习，让学生至少对一门学科产生兴趣，并深刻理解和掌握，由此促成学生学科理解力的持续发展，这是跨学科学习的重要价值。因此，跨学科学习必须在学科中、由于学科并为了学科。
