自然选择与中立学说
选择学说（达尔文进化论）：认为平衡和正选择是分子进化的驱动力。
中立学说（非达尔文进化论）：强调突变、净化选择和随机遗传漂移的重要性。
正向选择：某一位点逐渐积累，成优势的位点，具体表现为：随着时间延长，该位点的突变allele频率越来越高，远远超过野生型allele；
中性选择：随着时间的延长，总体频率没有改变太多；
平衡选择：位点呈现多态性，且一直保持着平衡，人类的ABO血型系统就是典型的平衡选择。
达尔文和中立理论
生物之间不仅存在有达尔文提出的生存竞争关系，还存在着协同生存、共同进化的关系；决定生物进化的原因，不仅有达尔文提出的自然选择学说，还有分子进化中性学说等。可见，达尔文主义存在五大缺陷:即只讲渐进,否认跃进;只讲渐灭,否定突灭和大绝灭;只讲种内进化,看不到种上进化;只讲生存竞争,忽视协同进化;只讲自然选择（外因）,不讲分子进化等内因。
