后宫里的眼中钉几乎被窦皇后全部拔掉。马太后过世以后，窦皇后在后宫中几乎是为所欲为了。
公元88年，章帝驾崩，窦太后抚养的太子刘肇即位，是为和帝。
此时和帝年仅十岁，尊窦皇后为皇太后。由皇太后辅佐，临朝听政。
有窦太后撑腰，几个兄弟在朝中就越来越嚣张，窦太后也大力任用自己娘家的人，以巩固自己的地位和势力。
窦氏在登皇后位不久，其兄窦宪就已经得到重用，现在为掌权太后，兄弟们就更加受到重用了，她的三个兄弟窦宪、窦笃和窦景都成为朝中重臣。
但是朝中都是自家兄弟，必定会有些人不服。窦太后就起用了跟随光武帝打天下的功臣邓禹的后代邓彪，将政局稳定下来。
为了增加军费以充实攻打匈奴的军力，窦太后改变章帝时的做法，增加了盐铁税。但派谁去攻打匈奴，还是一件很费脑子的事。
恰好这时，窦宪出事了。窦宪手握重权，此时已经位列三公之上。
窦太后对齐殇王的儿子很是喜欢，见这小子很讨妹妹的欢心，窦宪担心他会削弱自己的权力，于是想暗中将他置于死地。
没想到这事还没得手就被窦太后发觉。见妹妹发怒，窦宪恐惧之下，主动请缨去征讨匈奴，以弥补自己的罪过。
太后准了窦宪的请命，窦宪也不负众望，连战连捷，在汉朝声名大震。
窦宪手中握有兵权，征讨匈奴后名声大震，就有点按捺不住，预谋起兵谋反。
结果谋反未成又走漏了消息，和帝和宦官们一起将窦宪诛杀，并将窦氏家族为官者全部免掉，消除了窦氏外戚势力。
和帝将窦太后软禁起来，不许她再参与政事。公元前97年，窦太后忧郁而逝。
窦太后死后，大臣们纷纷揭发其罪行，要求和帝将窦太后的名号废黜。
念在养育之恩，和帝没有听从，在窦太后去世时，仍按太后的身份葬于敬陵。
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