打下安庆后，就剩下南京这块难啃的骨头了。这时也是曾国藩官场最顺利的时段，按照自己的设想排兵布阵，军饷也有了基本保障。本来按照曾国藩的计划，四支队伍合围南京。结果就他的亲弟弟不听他的命令，动作超快地早早到了南京城下，以他在安庆的成功经验来对付南京，结果，经过一天的绕城查看，发现南京真的如其兄所言，相当不容易对付。让他撤退也不撤，攻坚战、偷城战、地道战、间谍战想办法，这一下子就是将近三年啊，其间，李鸿章和左宗堂在江浙各地均进展顺利。最后有一条地道侥幸穿到南京城下，就这样，湘军终于进入了南京城，曾国荃终于放松了紧张的神经。
这历史性的胜利，按理说清政府应该不知该如何高兴，一定会封瓽曾氏兄弟。结果却收到了一封批评信。熟读史书的曾国藩马上意识到：清政府对自己以及他组建的湘军有了戒心。曾国藩从历史中得出经验：在高位一定要将权位推让少许。政府嫌其弟贪，各项问责。而曾国藩的行动也让清政府大吃一惊：让其弟离职l回家，并裁撤湘军。这就是易经中所说的：很多人知道怎么开始，但却不知道如何结束。这也体现了曾国藩的确不是一般人，料事如神。
另一方面，在曾国藩提拔的人中，有两人公开和其闹矛盾：沈葆桢和左宗棠。但曾国藩却把这当成人生必经的一些历练。看来曾国藩的确是朝着圣人的目标在做。
