杨一清等人没有异议，内阁就此奏报明世宗。
明世宗批示包含以下内容：
第一、王阳明放言自肆，诋毁朱熹，号召门徒声附虚和，用诈任情，到处聚众传习邪说，坏人心术。
第二、宸濠之变，王阳明与伍文定移檄举兵，擒获首恶，功固可録，但兵无节制，夸大虚报功劳。
第三、掩袭两广夷匪，恩威倒置。
第四、所封爵本当追夺，但系先朝信令，姑与终身；但他死后应该享受的卹典礼仪，朝廷一律不给。
第五、都察院应榜谕天下，敢有踵袭阳明邪说，非议圣人的，重治不饶。
明世宗同时密召杨一清，对他说：“王阳明窃夺儒名，实无方正之学；王阳明崇奉禅学，好尚鬼异，非孔门之士。平定宸濠之乱，实际上是伍文定的功劳，王阳明凭着上司的身份而袭功；而且王阳明见风使舵，眼看皇兄明武宗御驾亲征，知道宸濠必败，所以才和伍文定一起举事；朱宸濠在南直隶就被擒获，王阳明却回到南昌去杀人。两广之事，王阳明见对方强大，就屈为招抚，损害朝廷的威严；而对八寨却纵意杀戮。可见遇到强敌，他就不分首犯从犯，一律招安，遇到软柿子则任意杀戮，自夸建立了奇功。”
杨一清对明世宗和桂萼的一派胡言，罔顾事实，不加一句分辨，表示完全同意他们的意见。
三月二十九，挚友、南都吏部右侍郎湛若水作《奠王阳明先生文》，表示沉痛的哀悼，全文大意说：
上天生人，是有意的吗？还是无意的？上天如若无意，为什么赋予你超凡的智慧？上天如若有意，为什么让你早亡？
想当年我们在京师邂逅，便相互倾慕，后来又订下终身共学之盟。我们都崇尚程颢先生的《识仁篇》，认为仁与万物浑然一体。
您因言获罪，被贬龙场，我作《九章赠别》。
正德六年春，您从南京调回京师，寓居长安灰厂，与我为邻，我们每天的饮食起居几乎都在一起，存养心神，相互砥砺，剖析疑义。
我言圣学即“体认天理”，您问“何谓天理”，我答“廓然大公”。您没有反对，说佛老是圣学之枝叶。我说，既然同枝，必然同根。伊尹、伯夷、柳下惠与孔子同根，但释迦于我孔，根株咸二。
正德七年春，我离京出使安南，年末，您由吏部迁南都太仆寺少卿，我们南北分离。
