学习小组Day3笔记--gqx

在Linux系统中下载miniconda软件安装并使用
先上思维导图

Linux软件安装.png

代码记录:来源于生信星球学习小组

#查看服务器多少位的
 uname -a 
#复制下载链接(清华站点,最新版)
weget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
#安装miniconda
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
#激活conda
source ~/.bashrc
#添加清华镜像
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes
#安装指定版本的软件
conda install fastqc=0.11.7 -y      #-y表示安装过程的问题全部回答yes 

#建立conda环境,然后指定python版本是3,安装软件fastqc、trimmomatic
conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y
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