IP属地：吉林
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绘制染色体区块图目前绘制染色体的函数很少亦或者说绘制得很难看，因此有必要自己设计一个绘图脚本。绘图函数设计可以从头使用svg包来绘制，也可以使用一些现有包进行绘...
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PS1 设置命题提示符
PS1 常用格式化符号 \u: 当前用户名 \h: 主机名（短格式） \H: 主机名（完整格式） \w: 当前工作目录（相对路径） \W: 当前...
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vscode 中 python 没有智能提示解决方案vscode 中提供智能提示的方法有很多，其一就是自己编辑用户snippets，其二就是下载使用别人写的snippets插件。而我们使用pyth...
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基因家族分析
CAFE4 1.生成cds文件以及pep文件 2.orthofinder 比对，建树：orthofinder 比对的两个文件用于后续分析：Spe...
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JCVI
共线性分析 输入文件 序列文件和注释文件：序列文件默认只能输入cds文件（尾缀cds）,注释文件（尾缀bed）。--dbtype=DBTYPE ...
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MCScanX一.基本使用 输入文件： 运行命令： 这个 gff 文件需要将两个物种的GFF文件 cat 到一起 结果将会得到两个文件：file.collin...
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DRIMM 鉴定多个物种共有区块
挖掘多物种之间共有区块 1.orthofinder 获取 Orthogroups.tsv 文件 2.获取物种之间的拷贝数(查文献或ks分析) 3...
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重复基因鉴定原理
Gene duplication and evolution in recurring polyploidization–diploidizat...
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orthofiner
一. 使用 一般命令 这个命令会使用系统可以使用的全部线程进行后续分析 一些参数 中途运行的参数 使用 -b 参数时，在 OrthoFinder...