1. 孟德尔随机化方法 传统观察性流行病学研究在发现疾病病因以及因果推断中存在诸多挑战，比如反向因果关联、潜在混杂因素、微效暴露因素以及多重检验等，当研究者诉诸于随机对照试验...
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孟德尔随机化推断暴露因素与健康结局的因果关系 -
文献学习096--Dynamics of Cardiac Neutrophil Diversity in Murine Myocardial Infarction1. Time-Dependent Transcriptional Heterogeneity of Neutrophils in the Infarcted Heart 作...
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文献学习084--组织原位CCR2+巨噬细胞通过TLR9/MyD88/CXCL5 signaling促进neutrophil extravasation为了探究心肌缺血灌注损伤时调控中性粒细胞trafficking的upstream signals，作者使用了小鼠心脏移植模型（An essential advantage o...
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文献学习088--组织原位巨噬细胞通过SR A1-c Myc轴减轻阿霉素诱导的心肌病通讯作者： 1. Both Monocyte-Derived and Resident Macrophages Participate in DiCM Development...
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我是外科医生，所以很粗暴的哟！～～<br>欢迎大家关注微博“医学小蛋散”哦～<br>让学医快乐～ <br>记录行医之旅～
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计算特定细胞群对疾病状态的贡献度在单细胞测序揭示心梗后的心脏免疫动态变化[https://www.jianshu.com/p/c5043790077a]中，作者对MI不同时间点的小鼠心脏组织进行了单细胞测序...
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髓系细胞工具鼠汇总
一、巨噬细胞 1. Cre工具鼠 Cre工具鼠是通过在小鼠marker基因位点敲入Cre/CreERT2或者Dre/DreERT2元件构建而成。Cre工具鼠跟特定的flox小...
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CyTOF分析流程（一）：基于R语言的CyTOF数据预处理小鱼爸 2023-08-03 简介 质谱流式(Mass cytometry，CyTOF)得到越来越多的应用，适合用于深入表征健康和疾病组织异质性。目前，原始文件的预处理通常是...
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当红辣子鸡-空间转录组与单细胞转录组的整合分析（下篇）
作者：尧小飞审稿：童蒙编辑：amethyst SPOTlight SPOTlight 的目标是提供一种工具，能够对包含细胞混合物的每个捕获位置中存在的细胞类型和细胞类型比例进...
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logfc有区别，presto算的几何平均值，findallmarkers计算的算数平均值
单细胞之富集分析-1：单细胞GSEA分析流程
单细胞GSEA分析需要的文件有两个：1. 单细胞基因表达变化数据（两列，一列是geneid/gene symbol，一列是logFC）（文件格式：.rnk）2. 目标基因集（...
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T细胞接受抗原刺激后的五个阶段及其表型看到简书上 小牛学生信 老师的笔记，也来源于流式中文网，很不错，mark一下 2022-11-08 T细胞表征 - 简书[https://www2.jianshu.com/p...
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文献学习074--[sc]T cells specific for α-myosin drive immunotherapy-related myocarditis在此前的研究中，作者报道了一个ICI-MC小鼠模型，在这篇文章里，作者用的也是这个模型。 1. Cardiac clonal CD8+ T cells are abundan...
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文献学习094--自我更新的心脏组织原位巨噬细胞限制心梗后的adverse remodeling1. Single-cell analyses show unique cardiac macrophage subsets. Fig 1a： 对心脏CD45+CD64+CD...
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文献学习095--心脏原位巨噬细胞来源的Legumain通过促进心肌梗死后凋亡心肌细胞的清除和降解来改善心脏修复1. Lgmn Expression Increases After MI in Mice 为了确定参与endocytosis 和 intracellular traffic...
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不看私信<br>看不到的文章是被简书锁了
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文章复现 | WGCNA算法识别肾透明细胞癌CD8T细胞浸润相关关键基因前言：加权基因共表达网络分析（weighted gene co-expression network analysis，WGCNA）是研究相似基因表达模式的一种方法，通过寻找...
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TIMER20和cibersort一个既能分析测序数据（最好是TPM格式），又能分析芯片数据的网站细胞免疫浸润网站使用 1.cibersort 数据输入格式：输入数据的要求： 1.不可以有负值和缺失值 2.不要取log 3.如果是芯片数据，昂飞芯片使用RMA标准化，Ill...
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学习小组Day2笔记--知未1.什么是linux，什么是服务器？ linux是个操作系统，它开源、免费、稳定、安全...优点多多~ 主要作为服务器使用，支持多用户同时使用且相互独立，文件系统为树状结...
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