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EVM整合注释及报错
1 使用conda安装EVM。conda源的evidencemodeler 不是作者编译上传的，所以pasa的依赖和库都不在，如果是重新创建环境...
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PASA-alignAssembly PASA配置
安装mysql之后忘记密码了，查看用户，重置密码，加入pasa的用户和密码。 现在已经配置好mysql的用户和密码，可以进入下一步，去除污染序列...
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提取染色体对应三代hifi数据
近期做hic挂载发现一个物种的染色体有问题，需要把对应两条染色体的三代测序数据挑出，比对到两条染色体上查看深度，以及挑出这部分序列重新拼接，拿到...
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blastn报错
近期在集群跑几个污染分析的流程，从conda新装了blast，之后报错。 查询可知，是因为blastn版本跟不上，但事实上我安装了最新的blas...
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braker3注释基因组基因遇到的问题
1 安装 参照“基因组结构预测|Braker3流程”这篇知乎文章https://zhuanlan.zhihu.com/p/659050212[h...
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HiTE注释重复序列
使用conda安装HiTE 我本来打算安装好之后使用conda-pack迁移到服务器使用，运行之后发现有部分依赖并不能被conda-pack迁移...
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个人塔式服务器搭建-生物信息分析本文从1 功能需求，2 硬件选择，3 搭建过程 三个方面来阐述。 1 功能需求 最近在进行植物基因组的组装注释和分析流程，需要一台多线程的li...
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EDTA注释重复序列报错
使用conda安装好EDTA环境 运行后发现LTR鉴定过程报错 github搜索，发现问题与LTR_retriever有关，遂指定LTR_ret...
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解决Repeatmodeler运行报错
使用conda安装了Repeatmodeler，版本为Version 2.0.5。在基因组重复序列注释过程中运行时间 过长，而且最终产生的文件中...