大家好，上一期介绍了GWAS的基本原理，中间提到了基因型数据。基因型数据的获取方式有很多，例如基因芯片、简化基因组测序、全基因组重测序等。在人类中通过基因芯片获取的测序数据往...
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GWAS基因型文件介绍——VCF文件
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LDdecay（连锁不平衡检测）
1 安装PopLDdecay，优点：方便不需要转换格式（plink需要） ## 下载 git clone https://github.com/BGI-shenzhen/Po...
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Haploview软件使用-连锁不平衡分析
当位于某一座位的特定等位基因与另一座位的某一等位基因同时出现的概率大于群体中因随机分布的两个等位基因同时出现的概率时，就称这两个座位处于连锁不平衡的状态。目前，连锁不平衡分析...
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2020-01-10 分析SNP位点：连锁不平衡-可视化R包LDheatmap参考学习资料：https://cran.r-project.org/web/packages/LDheatmap/LDheatmap.pdf 二代测序得到的那些SNP，有些是...
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GWAS笔记2-连锁不平衡LD连锁不平衡（linkage disequilibrium）是进化生物学与人类遗传学中一个十分重要的概念，因为遗传过程中很多因素能够影响它，而它又会作用于很多因素，包括选择，重...
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连锁不平衡以及连锁不平衡衰减[连锁不平衡粗俗的说就是：这几个基因耍流氓，喜欢抱团遗传，不再随机。而连锁不平衡衰减是指在基因组上，随着物理距离的增大，两个连锁的的等位基因的连锁程度不断减小。] LD衰减图...
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基础知识——连锁不平衡 Linkage disequilibrium (LD)一、概念 连锁不平衡是指,在某一群体中，分属两个或两个以上基因座的等位基因同时出现在一条染色体上的几率，高于随机出现的频率。连锁不平衡是等位基因或者遗传标记在一个种群中表现出...
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【糖尿病.2003】糖尿病、氧化应激和抗氧化剂：综述文献DOI： 10.1002/jbt.10058 文献PMID： 12616644 文献原文链接： http://doi.org.sci-hub.tw/10.1002/jbt...
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【创面修复.2011】糖尿病慢性伤口非愈合患者氧化应激与细胞凋亡标志物的关系&Relationship between oxidative stress and apoptotic markers in lymphocytes of diabetic...
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功能解剖学1-8.Codman矛盾理论《功能解剖学》读书笔记之【8.Codman矛盾理论】 Codman操作法执行如下※在参考位置（图1-26侧面观，图1-27后面观），上肢下垂于躯干两侧，拇指向前，手掌朝向内侧...
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从一篇11分SCI看孟德尔随机化怎么发高分大家好，好久不见，现在纯做转录组想发个文章已经越来越卷了，而且好多期刊已经明确规定了要加实验，对临床gou特别不友好。那么有没有不用做实验还可以发高分的文章呢？答案很明确，是...
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R数据分析：孟德尔随机化实操
好多同学询问孟德尔随机化的问题，我再来尝试着梳理一遍，希望对大家有所帮助，首先看下图1分钟，盯着看将下图印在脑海中： [图片上传失败...(image-9bf17c-1668...
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转录组数据绘制PCA图以及生物学重复的相关问题
很久没有跟新啦~~~忙着基金。。基金。。还是基金，然后就是文章。。文章。。还是文章。终于有空整理之前的东西。 说绘图方法之前先要了解，转录组的PCA图的意义是什么？为了检测样...
