通常来说，真核生物的基因，这里主要指的是植物gene的克隆，常以cDNA为模板进行克隆。这就有个问题，很多同学想要的基因尝试克隆了N多次都拿不到，这就很恼火，连基因都拿不到，...
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为什么想要的gene克隆了n多次都得不到？是不是应该考虑下反转录……
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转录组分析学习笔记---文件结构和类型
转录组分析学习笔记---文件结构和类型 BED文件每行至少包括chrom，chromStart，chromEnd三列必选;另外还可以添加额外的9列可选，这些列的顺序是固定的。...
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技巧（1）——利用SnapGene构建载体，模拟基因克隆，酶切，连接及电泳检测做实验嘛，时间和精力的合理分配很重要，利用有限的时间高效完成各项实验的准备工作就显得尤其必要。毕竟需要把更多的时间花在研究文献上面，然后仔细验证实验思路，最后快快的做实验。 ...
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Original tree 和 bootstrap tree 区别联系
丁香园“花脱[https://www.dxy.cn/bbs/newweb/pc/profile/1016288]”答主： Original Tree 是步长检验构建的 N次株...
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python统计cds序列中不同密码子的个数
需求 给定cds序列，统计不同的密码子出现的频率。首先需要将fasta序列以3位单位分割 找到了一个办法https://www.jb51.net/article/139207...
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密码子偏向性的ENC-plot使用R语言的ggplot2包绘制密码子偏向性分析中的ENC-plot 到这一步有人遇到报错Error: `mapping` must be created by `aes()...
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多序列比对,进化树分析,motif预测,密码子偏好性分析(1)多序列比对,进化树分析,motif预测,密码子偏好性分析(2) 前言：假如类鼻疽杆菌中发现有一个感兴趣的gene，想查看此gene在各类鼻疽菌株甚至原核生物和真核生物中是否也...
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RNAseq-踩坑02 -- Aligment 比对率低RNAseq的第二步就是Aligment, 一般都是有参考基因组的比对，据同事介绍，比对这一步，比对率再80%以上才算是正常的，很多样本的比对结果都能达到90%以上。 然而，...
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同源基因概念（直系同源 vs旁系同源 ）分子进化与系统发生 拉马提出进废退理论。他说生物经常使用的器官会逐渐发达，不经常使用的器官会逐渐退化。而且这种后天获得的性状是可以遗传的，因此生物可以把后天锻炼的成果遗传给下...
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基因家族分析--需要分析什么
1、搜索基因家族成员蛋白保守结构域，鉴定基因家族成员； 2、预测基因家族成员的顺势作用元件； 3、构建系统进化发育树； 4、基因家族成员MOTIF分析及绘图； 5、基因结构图...
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转录组分析(6) - 基因注释目的 基因功能的注释依赖于基因结构或者序列，将基因序列或蛋白序列和主流数据库进行比对获取该基因的功能信息，最终对预测的编码基因进行功能注释，从而了解相关生物学意义。 做法 E...
