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    hicexplorer 报错"`np.object` was a deprecated alias for the builtin `object`."

    在跑任务的时候又遇到报错,hicAggregateContacts命令行报错 气急败坏之下惯性使用chatgpt, 显示需要降numpy版本. ...

    0.9 29 0 2
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    R 包 methylKit 排错

    R 包 methylKit(GitHub - al2na/methylKit: R package for DNA methylation an...

  • coolpuppy报错原因

    昨天在使用plotpup.py 画 hic 的热图时遇到问题,反复试了两个多小时. 报错如下: 百思不得其解. 后面意识到这个软件对格式都有严格...

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    Gephi 的简单使用

    下载.这个是免费软件,直接去官网下载 https://gephi.org/[https://gephi.org/]. 下载完成之后打开软件,准备...

  • 解决报错ImportError: cannot import name 'GC' from 'Bio.SeqUtils'

    简单记录.在安装软件的时候遇到ImportError,模块找不到.在我的情况中是因为biopython的版本问题. 所以,降低biopython...

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    <转发>如何高效回复审稿人意见(附实例)

    来自---如何高效回复审稿人意见(附实例) - 来研的文章 - 知乎https://zhuanlan.zhihu.com/p/491096355...

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    Fit-hic 2 通过hic数据检测显著性互作

    安装官网中提到三种安装方法,可通过conda, pip,git clone 安装该软件.我们这里利用conda,非常简单快速.1.1 conda...

  • [报错记录]:deeptools报错AttributeError: module 'numpy' has no attribute 'float'.

    完整报错信息 在我的情况中,降低numpy版本就能解决 降低为numpy==1.18.3

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    3D genome builder--根据hic数据和ChIP数据预测基因组3D模型

    一开始觉得用hic数据预测基因组3D结构还是挺有趣的,但是用了几个软件反反复复折腾效果并不好,快失去耐心了。偶然间看见一篇新的文献,觉得正是我所...