之前我们已经讲述了Cellphonedb的安装配置和数据分析，就差可视化了，这里简单说一下常见的可视化，如果需要其他更加个性化的可视方式，就需要发挥自己的聪明才智了！ Cel...
IP属地：上海
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一文解决Cellphonedb单细胞互作分析及可视化作图（2） -
cellranger使用的初步探索（3）cellranger aggr在学习cellranger aggr这一步之前，还是需要再一次复习10x Genomics的测序原理。在cellranger aggr部分，官网（https://suppor...
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神兵利器——单细胞细胞类群基因marker鉴定新方法：COSG在单细胞数据分析当中，当我们聚类分群完成之后，紧接着就是细胞类型注释，细胞类型的注释就离不开 基因marker ，即在目标细胞类群和其它细胞类群之间呈现出不同表达模式特征的基...
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连雨不知春去，一晴方觉夏深
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Cellrank：细胞分化轨迹的新秀说在前面 说到细胞分化轨迹的推断，想必很多小伙伴第一会想到的是monocle2这个软件，但是它只能做到oneshot，不能捕捉到细胞分化的动态过程。另一种高阶的算法是RNA速...
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Seurat4.0系列教程1：标准流程时代的洪流奔涌而至，单细胞技术也从旧时王谢堂前燕，飞入寻常百姓家。雪崩的时候，没有一片雪花是无辜的，你我也从素不相识，到被一起卷入单细胞天地。R语言和Seurat已以势如破竹...
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