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ggplot2: geom_smooth() & stat_smooth() -
DoHeatmap的优化+ComplexHeatmap绘制带特定基因的单细胞热图单细胞绘图系列： Seurat绘图函数总结[https://www.jianshu.com/p/95e61f7e834d] 使用ggplot2优化Seurat绘图[https...
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cellranger multi使用（单细胞转录组+VDJ）单细胞大多数东西我都不是那么想写，因为就是照着流程抄。而且写的人挺多的了，不差我一个。但是最近谷歌了一下cellranger multi的中文教程，都没有让我满意的，就写一个...
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Docker部署Rstudio Server【二】：docker多参数设置
上一节内容我们成功将Rstudio Server镜像运行起来，这一节让我们把docker镜像打造成可实际使用的工具。 docker镜像运行中的关键参数 目录映射-v dock...
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文献速递||R包DropletUtils-基于droplet的单细胞转录组数据cell calling方法欢迎关注同名公主号：BBio 10X也是基于此文献的，考古一下，学习区分空载和真实细胞大体思路。 当时已经存在的一些方法会假设含有细胞的GEMs会有更高的UMI总数，并以UM...
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scCustomize：自定义可视化你的单细胞数据（一）简介 scCustomize是一个单细胞转录组数据可视化的R包，里面集合了一些常用的数据可视化方法，可以与Seurat包进行很好的联用，支持Seurat，LIGER和SCE等...
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Scissor：联合表型数据,Bulk-seq和scRNA(1)在上篇棉花相关的单细胞帖子我提到过： 文中是这样说的：Guided by the bulk samples of cotyledons (0, 12, 24, 36 and ...
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ggplot修饰monocle2拟时热图：一众问题全部解决上周微信小伙伴问了一个图，想要用ggplot做拟时热图，其实我在看文献的时候，已经想要复现了，所以这里写一篇帖子，将一众问题一网打尽。**这是一篇超长贴，我们的内容还是一如既...
