pvalue(pval): 统计学差异显著性检验指标。qvalue(p-adjusted): 校正后的p值(qvalue=padj=FDR=Corrected p-Value...

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对于只有fpkm的rnaseq数据不友好
R语言:DESeq计算组间Fold Change导读 利用R语言DESeq2函数包deseq函数分析两组间细菌丰度的差异,寻找组间abs(log2FoldChange)显著大于1的细菌。 一、下载安装 也有其他的下载安装方...
必须是count整数
R语言:DESeq计算组间Fold Change导读 利用R语言DESeq2函数包deseq函数分析两组间细菌丰度的差异,寻找组间abs(log2FoldChange)显著大于1的细菌。 一、下载安装 也有其他的下载安装方...
基因表达差异分析是我们做转录组最关键根本的一步,edgeR+limma是目前最为推荐的方式。本文结合示例数据,将对这个过程进行梳理,让你明白limma包的why,what,h...
如题 自由发挥自由扩散
kNN算法原理 1、K最近邻(k-NearestNeighbor,KNN)分类算法,是一个理论上比较成熟的方法,也是最简单的机器学习算法之一。该方法的思路是:如果一个样本在特...
@生信学霸 今天也不行
“GSEA简易分析工具”和” GSEA结果可视化工具”为了解决四个难题我们设计开发了“GSEA简易分析工具”和” GSEA结果可视化工具” 01—研究背景 Gene Set Enrichment Analysis (基因集富集分...
对于txt的表达数据,直接改后缀ds吗?
如果我想用基因表达分组,如何设置input.cls
GSEA基因富集分析R语言版GSEA基因富集分析R语言版 官方github地址[https://github.com/GSEA-MSigDB/GSEA_R] 1.安装 library("devtools...
注册时候手机收不到验证码,打电话没人接
“GSEA简易分析工具”和” GSEA结果可视化工具”为了解决四个难题我们设计开发了“GSEA简易分析工具”和” GSEA结果可视化工具” 01—研究背景 Gene Set Enrichment Analysis (基因集富集分...
欢迎大家关注我的公众号:一只勤奋的科研喵[http://mp.weixin.qq.com/mp/homepage?__biz=Mzg2MjU2NDQwMg==&hid=2&s...
Logistic回归分析(logit回归)一般可分为3类,分别是二元logistic回归分析、多分类Logistic回归分析和有序Logistic回归分析。logistic回...