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    Rosetta 简易手册

    这部手册的基本思路(如何使用我) 在 Rosetta入门 这一部分,我记录了Rosetta能够解决的生物问题及其使用的抽样策略,主要包括:如何将你的问题转化为Rosetta可...

  • 用POVME3.0计算蛋白质口袋和聚类

    https://github.com/POVME/POVME 首先按照教程安装povme3.0,每次使用的时候,用一个单独的python27环境,source 路径/mini...

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    NC | 拟杆菌门利用数以千计的酶分解多糖

    文章信息: 文章:Bacteroidetes use thousands of enzyme combinations to break down glycans中文:拟杆菌...

  • dbCAN:CAZyme序列和注释数据库

    文献信息: 标题:dbCAN-seq: a database of carbohydrate-active enzyme (CAZyme) sequence and anno...

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    用vmd将gromacs轨迹转换为动画

    1 压缩gromacs的trr轨迹文件 #因为trr格式的轨迹文件包含轨迹 坐标x, 速度v和力f的信息(二进制, 全精度, 可移植),因此占用内存较大。我们把trr格式轨迹...

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    分子对接——学习笔记

    一、Pymol处理蛋白: 获取对接的受体蛋白 pymol> fetch 6sj4 删除多余的链pymol>remove chain B 删除水分子 pymol> remove...

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    #MD#模拟教程:GROMACS之載脂蛋白模拟

    GROMACS之水中部分載脂蛋白 本教程来自于李继存老师博客:http://jerkwin.coding.me/GMX/GMXtut-1/#%E6%A6%82%E8%BF%B...