@曹草BioInfo 不好意思，这是真的不太懂
二代群体遗传与重测序（下）五.种群历史与基因交流 书接上回https://www.jianshu.com/p/0147afc3334c[https://www.jianshu.com/p/0147af...
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@曹草BioInfo 你好，我使用mcmc2中的makeMappabilityMask.py进行转换但是所有的bed.gz里面都是空的，看了很多都没有说怎么转换，请问方便提供一下mask.fa文件中需要屏蔽的区域转换成bed文件
的脚本吗？二代群体遗传与重测序（下）
五.种群历史与基因交流 书接上回https://www.jianshu.com/p/0147afc3334c[https://www.jianshu.com/p/0147af...
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@吴糖气泡水_84f9 请问您有解决这个问题吗？
fastsimcoal2推断群体演化历史(Demographic history)
1. 群体演化历史分析的案例： 群体演化包括有效群体大小(Ne)变化、基因流，迁徙，分化等，会对等位基因频率产生显著影响，塑造了现有遗传多样性的模式和水平。群体演化、遗传漂变...
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@略略略_7c34 你好，请问你解决这个问题了吗
fastsimcoal2推断群体演化历史(Demographic history)
1. 群体演化历史分析的案例： 群体演化包括有效群体大小(Ne)变化、基因流，迁徙，分化等，会对等位基因频率产生显著影响，塑造了现有遗传多样性的模式和水平。群体演化、遗传漂变...
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你好请问如何由mask.fa文件中需要屏蔽的区域转换成bed文件
二代群体遗传与重测序（下）
五.种群历史与基因交流 书接上回https://www.jianshu.com/p/0147afc3334c[https://www.jianshu.com/p/0147af...
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samtools和bcftools的安装Linux只是爱好，生信才是生活。得安装一些常用的软件了。 1samtools安装 需要的包也太多了，希望这些都行都能整一个自动安装依赖包的功能，或者像gcc那样，附带个脚本...
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@bililililili 你好，请问你有重构转录本吗？我也在想，如果我对发现新基因不感兴趣，是不是就可以直接比对、bam排序之后，进行计算FKPM了。
关于stringtie定量基因的时候，最后输出很多MSTRG样式的geneid
相信大家在用hisat2-stringtie-DESeq2这一套流程做差异表达基因分析的时候的时候，最后会输出很多带MSTRG字样的geneid。 我一开始搜索这个问题，...
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@China与天儿 您好，请问您解决这个问题了吗？
RNA-seq用hisat2、stringtie、DESeq2分析
一、安装软件 1、HISAT2 将reads比对到基因组上 2、StringTie 将比对好的reads进行拼装并预计表达水平 3、SAM tools 课上已经用sudo a...
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@李五四 您好，请问您解决了吗？
RNA-seq用hisat2、stringtie、DESeq2分析
一、安装软件 1、HISAT2 将reads比对到基因组上 2、StringTie 将比对好的reads进行拼装并预计表达水平 3、SAM tools 课上已经用sudo a...