240 发简信
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    R语言机器学习-caret

    介绍 caret包(Classification and Regression Training)是一系列函数的集合,它试图对创建预测模型的过程进行流程化。本系列将就数据预处...

  • wig、bigWig和bedgraph文件详解

    from 生信菜鸟团(http://www.bio-info-trainee.com/1815.html) 我们一般会熟悉sam/bam格式文件,就是把测序reads比对到参...

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    scRNA-seq拟时分析 || Monocle2 踩坑教程

    拟时(pseudotime)分析,又称细胞轨迹(cell trajectory)分析,通过拟时分析可以推断出发育过程细胞的分化轨迹或细胞亚型的演化过程,在发育相关研究中使用频...

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    读《R语言面向对象编程》

    R主要面向统计计算,为数据科学家青睐,代码量一般不会很大,使用面向过程的编程方式就可以很好的完成编程任务。而且还是有RStudio这样的交互操作集成开发环境,所以大部分的R语...

  • 了解自己很难,但是真的很重要

    我个人对自己的了解都不同,有时候会感觉自己了解得已经很详细,有的时候却又对自己的了解很是迷茫,想不透自己究竟怎样! 人呐!很多时候都是一个自我矛盾的共同体。 其实要了解自己最...

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    Chip-seq原理篇

    CHIP-seq 染色质免疫共沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)也称结合位点分析法,是研究体内蛋白质与DNA相互作用的有力工具,...

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    01.单细胞入门-Seurat对象创建

    单细胞测序下游原始文件主要以三种形式在GEO存储 针对三种不同的存储形式分别对应不同的seurat对象创建方式 1.以标准的barcodes.tsv、genes.tsv、ma...

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    单细胞测序分析之Seurat(3.0)包学习笔记

    上一篇文章深入学习了Monocle2包,这次来继续学习Seurat包。Seurat官方网站:https://satijalab.org/seurat/v3.1/pbmc3k_...

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  • 您好,我是一名自学生信的学子,本科跟着神经方向的老师,现在跟着代谢组学方向的老师。因为疫情不能返校,所以想自学生信,将生信分析应用于肿瘤的代谢组学分析和神经生物学的分析当中。对于自学生信的人来说,结合您的笔记去学习Jimmy大神的教学,事半功倍,在此向您表示诚挚的感谢!我正在备考托福和雅思,希望将来能去美国或者英国读博,如果能有幸申到offer,希望会有缘分和您交流。网络上负面的东西还请您不要在意,当犬吠尔,您帮助了我们这样的积极向上的人,也希望您有一个好心情~

  • 简书笔记汇总

    以下是我简书里所有的文章链接,按不同的专题分类,方便大家根据不同专题以及文章题目快速的查看所需内容。 持续更新中~ Linux学习笔记 《Linux命令行与shell脚本编程...

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    Dream it. Wish it. Do it.【送给所有支持我的小伙伴们】

    距离第一篇简书笔记(2019-8-20)已经一年有余了,本来是想在一周年的时候写一篇心路历程的,后来一想,还是等到粉丝数破千的时候再写更有意义。因为正是这些支持我的小伙伴们的...

  • 暂别简书,后会有期

    我不是老师,也不是大神,更不是前辈。我只是个普通的科研工作者,一个只想努力变得更好的人。 来到简书快3年了,期间写了不少的笔记。很多的笔记是在疫情严重时wfh的时候写的。至今...