介绍 caret包(Classification and Regression Training)是一系列函数的集合,它试图对创建预测模型的过程进行流程化。本系列将就数据预处...
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from 生信菜鸟团(http://www.bio-info-trainee.com/1815.html) 我们一般会熟悉sam/bam格式文件,就是把测序reads比对到参...
拟时(pseudotime)分析,又称细胞轨迹(cell trajectory)分析,通过拟时分析可以推断出发育过程细胞的分化轨迹或细胞亚型的演化过程,在发育相关研究中使用频...
R主要面向统计计算,为数据科学家青睐,代码量一般不会很大,使用面向过程的编程方式就可以很好的完成编程任务。而且还是有RStudio这样的交互操作集成开发环境,所以大部分的R语...
我个人对自己的了解都不同,有时候会感觉自己了解得已经很详细,有的时候却又对自己的了解很是迷茫,想不透自己究竟怎样! 人呐!很多时候都是一个自我矛盾的共同体。 其实要了解自己最...
CHIP-seq 染色质免疫共沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)也称结合位点分析法,是研究体内蛋白质与DNA相互作用的有力工具,...
单细胞测序下游原始文件主要以三种形式在GEO存储 针对三种不同的存储形式分别对应不同的seurat对象创建方式 1.以标准的barcodes.tsv、genes.tsv、ma...
上一篇文章深入学习了Monocle2包,这次来继续学习Seurat包。Seurat官方网站:https://satijalab.org/seurat/v3.1/pbmc3k_...