序列比对是生物信息学研究中一种常见且经典的手段。经过多年的发展，序列比对也诞生了很多种方法，这篇文章选择讨论的是两种比较常见的序列比对方法，选择哪种比对方法也是科研中容易踩坑...
IP属地：上海
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序列比较中ClustalW和BLAST的区别 -
重测序分析
重测序：是对已对已知基因组的物种进行测序，去挖掘不同个体和群体之间的差异性。 重测序分析内容： SNP，INDEL, SV , SNV 进化分析，群体结构： LD,FST 分...
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安装htslib
我在github上获得的htslib安装包无法成功安装： 问题主要出在了git submodule update --init --recursive，看了很多网络上的教程，...
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基因的显性效应(Dominance effect)和上位性效应(Epistatic effect)1. 基因的显性效应 简单的说，就是等位基因的互相作用产生的效应。这里有一个等位基因，理解了就好办了。我们知道基因在染色体上的位置就像一个绳子上面的节一样，有它自己的位置(...
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BLAST分类BLASTn：用核酸序列搜索核酸序列数据库 BLASTx：将核酸序列按6条链翻译成蛋白质序列后搜索蛋白质序列数据库 tBLASTn：用蛋白质序列搜索核酸序列数据库，数据库中的...
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R语言match函数的应用举例
数据筛选是在分析中最常用的步骤，如数据挖掘分析中，从TCGA或GEO得到的表达矩阵要不断筛选，来进行数据整理。match函数是生信技能树生信爆款入门课程[https://mp...
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VCF文件解读
1.vcf格式说明 VCF格式：Variant Call Format，用于记录variants (SNP / InDel)的文件格式，关于其说明，详见：http://gat...
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基因组浏览器IGV实践IGV( Integrative Genomics Viewer)是一款针对高通量测序数据进行可视化的专业软件。 软件安装软件下载,运行需要 Java 的运行环境。 优点满足...
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bam文件的理解做生信分析的小伙伴们，相信大家对bam文件都不陌生，但具体到如何get到bam文件提供给我们的信息，却少有人真正的理解，最近我做了相关的学习，和大家分享以下我的理解，具体...
