@花生学生信 您好，bedtools的处理产生的原始数据格式就可以被识别是把？他的数据下载链接现在进不去了。如能告知感激不尽
GenomeSyn基因组共线性及结构变异可视化工具三代Pacbio和Nanopore测序技术的快速发展推动了比较基因组学领域的进步，泛基因组构建和结构变异识别成为该领域研究前沿。其中，共线性分析是比较基因组学的重要组成部分，...
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一套比较简便的基因组组装流程V2.0
之前写过 一套比较简便的基因组组装流程[https://www.jianshu.com/p/a736b1b4b188]，时间快2年了，现在新技术，新方法出来了，有更好的的方法...
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动植物基因组组装（华中农已毕业的生物狗）的分析小经验，不定时记录日常搬砖踩坑记录，欢迎互相交流学习~<br>学无止境，温故而知新~
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生物信息民工，真正的民工。你们会写软件、写流程，我都不会。
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最近不知道为啥conda create -n maker -c bioconda maker，直接装不上了。环境一直匹配不好
MAKER 进行基因预测
maker结合了重复序列屏蔽，augustus，genemark，snap从头预测，同源注释以及RNA-seq的方法，其本身并不属于一种预测基因的方法，其为一套整合各个方法的...
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没有~/.kobasrc这个文件
kobas安装
一、自行下载安装： 进入kobas官网[http://bioinfo.org/kobas]点击下载，对应的安装包和数据库。 二、conda 安装(推荐) conda 安装 k...
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GWAS全基因组关联分析全流程
拖拖拉拉用了一年时间才把GWAS整个流程捋完，从背景到code、还有过程中遇到的一些bug以及解决办法，加起来也有二十余篇，按分析的流程整理出一份清单，也许以后有新的方法或者...
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一些学习心得和记录<br>
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备忘！<br>备忘！<br>备忘！
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Pacbio 三代全长转录组IsoSeq3数据分析pacbio三代全长转录组数据分析isoseq31 参考官方文档及其他教程，包括原理、流程等 2 软件安装主要参考pbbiocondapbbioconda提示需要安装pyth...
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PASA（2.4.1）使用记录
文章仅是记录自己的学习使用，有错误请指出，我立刻改正！ 官方说明：https://github.com/PASApipeline/PASApipeline/wiki[http...
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【基因组注释】ncRNA注释1. ncRNA 非编码RNA(Non-coding RNA, ncRNA) 包括rRNA，tRNA，snRNA，snoRNA 和microRNA 等不编码蛋白质的RNA，它...
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生信Linux常用命令（更新中）
一、压缩和解压缩 1.“.tar.gz”结尾的文件: tar tar -cf newfile.tar file1 file2#将file1，file2文件打包到newfile...
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二代测序最上游的文件处理问illuminna测序最上游得到的文件是什么？很多人会回答是fastq文件。其实不是，而是bcl文件。但是一般的公司只会提供处理好的fastq序列给人。为什么这样呢？为什么...
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学会正确选择多序列比对（coding-sequences）软件前几天，实验室的师弟师妹通过本地blast获取一些没有基因组注释物种的蛋白编码序列。原本以为可以快速地进行下一步的选择压力分析，没想到却在多序列比对这一环节出现了棘手的问题。...
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简化基因组群体分析1.stack寻找位点1)数据预处理数据下机经过拆分去接头获得原始数据 由于拆分数据用的引物街头长度不一，获得的原始数据的长度也有差异，这对后续stack分析有影响，这里为了...
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