发简信
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BSA
我就是Super Star——基因定位之BSA[https://mp.weixin.qq.com/s/PWx8r8xkre7ck2P1C_MG5...
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GWAS之Beagle使用下载地址 使用 和数据格式有关的参数： gt(genotype data ): 表示基因型数据。指定输入文件的每个标签包含基因型数据 gl( g...
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snpEFF进行VCF注释2026-01-13群体遗传研究中，在获得SNP位点后，我们需要对SNP位点进行注释，对这些SNP位点进行更深的了解，比如哪些是启动子区突变、移码突变等，以便下一步...
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liftover——不同基因组座位转换
简介The liftOver tool is useful if you wish to convert a large number of c...
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2025-10-22基于重测序dCAPS标记开发之引物设计
1、获得vcf文件，找到两个差异材料（双亲）之前的多态性位点SNP。（1）SNP可以根据测序深度、基因型等进行过滤，测序深度异常（特别是过低的）...
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蛋白结构分析：AlphaFold3预测及PyMOL比对一、预测MT原蛋白结构 访问AlphaFold3官网：打开网址https://alphafoldserver.com/[https://alph...
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设计dCAPS标记及其酶切产物产物电泳区分的实验设计dCAPS标记及dCAPS标记酶切产物电泳实验 dCAPS标记的使用原理，如图A（参考NCBI）所示： 可以简单的理解为：在wild的片段中...
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曼哈顿图--R可视化曼哈顿图(Manhattan plot)是一种GWAS分析中常用的展示基因组数据的散点图。可以R语言中的qqman、CMplot及ggplot2...
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格式转换--2024-03-23
格式转换hapmap格式：hmp.txtplink格式：ped和map以及二进制文件bed/bim/famvcf格式：vcf 1. hapmap...