写在前面 最近，自己在绘制进化树的分析，那么自己也总结一下相关的教程吧。对于进化树绘制的教程全网依旧是很多的。自己作为初学者，也是根据这些教程来学习，来做分析。做物种或基因的...
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iqtree+ggtree绘制进化树教程 -
「r<-Shiny」用户界面（二）输出控件UI 中的输出控件创建了占位符，它随后被后端函数生成的内容所填充。与输入控件一样，输出控件的第 1 个参数也是一个唯一的 ID：如果你的 UI 有一个输入控件的 ID 是 "...
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R语言练习题10道，有答案代码，还有视频来源：http://www.bio-info-trainee.com/3750.html答案：https://github.com/jmzeng1314/R_bilibili...
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nsSNPs致病性分析（一）： 自己写脚本分析蛋白质保守性
——仅以此纪念自己半路夭折的工具开发计划 初衷： SNV有很多类型，其中落在编码区域的非同义突变 (nsSNPs) 会带来氨基酸序列的改变，很可能带来不良的影响，但是其影响程...
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蛋白质组学数据分析——（1）原理当前，关于高通量蛋白质组学的研究远不如NGS这般火热，网上关于这方面的知识也寥寥无几，从事这一行也有一段时间了，但还没好好总结过。加之过段时间可能要去做培训，所以是时候把知识...
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R | ggmsa: 多序列比对的可视化
参考：ggmsa: a visual exploration tool for multiple sequence alignment and associated data...
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这或许是我写的最全的BLAST教程Basic local alignment search tool (BLAST) 包括：blastn, blastp, blastx, tblastn, tblastx等....
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R语言批量爬取NCBI基因注释数据网络爬虫（web crawler），也叫网络蜘蛛（spider），是一种用来自动浏览万维网的网络机器人。其目的一般为编纂网络索引。各大搜索引擎都可以被看做爬虫，根据爬取的内容...
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生信技能树：https://vip.biotrainee.com/ Openbiox： https://community.openbiox.org/ 公众号：优雅R 生物数据分析QA，技术文档与博客，需要你的参与。 ……………………………… 欢迎在简书创作和做笔记的生信学习者、爱好者以及相关编程人员加入本专题，贡献你的文字，无论是原创还是笔记，我们需要你，将本专题打造为生信知识宝库、交流平台。 内容可以是对生物信息学与算法知识相关资源的收集、整理，以及原创笔记： * R * Python * Perl * Linux 工具与编程 * 绘图 * 统计 * 计算生物学 * 各类算法 * 机器学习
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使用R语言进行卡方检验（chi-square test）文|程瑞林（山东大学第二医院足踝外科）来源|（微信公众号）云中瑞麟（ID：ruilinfly） 瑞麟导读：对于计量资料，临床医学研究中常用的统计分析方法是t检验；而对于计数资...
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R语言-05数据框创建，以及按条件取数据框数据
创建数据框 数据框是R语言的一种基础数据格式，通常excel等表格形式数据读入后都是数据框格式。 下例创建了一个3列5行的数据框，列的名字分别是site、season、pH ...
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R数据可视化19:环状条形图之前我们已经讲过很多条形图啦，但是今天我们再来讲一种条形图——环状条形图（Circular barplot）。当厌倦普通的条形图的时候或者空间有限但是要展示较多样本的时候，都...
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ComplexUpset---强大的Veen绘制包
ComplexUpset是非常强的Veen图绘制软件包，平时Veen的绘制最多能达到6个相交，而此包对于就是针对6个以及以上的交互所准备的。特此推荐，以下模板可直接套用。 一...
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R语言实战 | 新手福利~认识数据集的内在
"R实战"专题·第4篇 编辑 | 科白君 本期推送内容 按个人的要求来创建含有研究信息的数据集，这是任何数据分析的第一步。同时，这也是学习R语言过程重要的入门环节。特别是初学...
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R语言实战 | 新老福利~解放双手的rstudio快捷键
"R实战"专题·第5篇 编辑 | 科白君 本期推送内容 学习方法一定是在学习过程中占最主要的。最近学了一些新的小技能，掌握了不少rstudio软件中高效率的快捷键。我认为，这...
