前言 对于很多小伙伴来说，刚入手生信时接触最多的就是差异分析，即在基因组层面可以算突变率差异，转录组层面可以算基因表达水平差异，表观组可以观察甲基化水平差异，蛋白质组/代谢组...
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一文理清常见的基因富集分析
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R-clusterProfiler: GO/KEGG + 可视化常用的分析方法： 过表征分析 (over representation analysis, ORA) ：先找出差异基因，再对差异基因进行如GO/KEGG等富集 基因富集分析 ...
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2021-07-01 GO、kegg富集分析What：什么是GO和KEGG？ GO全称是Gene Ontology，它分为：细胞组分（cellular component, CC）、分子功能（molecular fun...
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表观遗传--RNA甲基化之m6A前沿 表观遗传学，包括组蛋白共价修饰(covalent histone modification)、DNA甲基化修饰(DNA methylation)、RNA甲基化修饰(RN...
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简单，随性，认真，运动 <a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fwww.jacksonyoudi.com%2F" target="_blank">https://www.jacksonyoudi.com/</a>
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R语言入门最近在复习python的科学计算，突然心血来潮，想看看R的数据处理和python的区别在哪，所以就有了这篇文章。 R语言简介 四十多年前， R 语言的始祖诞生了 ， John...
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exomePeak的使用R：http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/exomePeak.html 安装：# 看来作者更新的挺好 ...
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edgeR的简单实用流程前些天，实验室里的同事，为了补充计算几个比较组合的差异分析，花了几千元，真够冤枉的。但碍于我们实验室对生信技术的鄙夷，我也懒得理睬。这里简单介绍一下如何使用edgeR进行差异...
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limma的两个弟弟：edgeR和DESeq201—研究背景 上一篇公众号我们为大家详细的介绍了R软件包limma筛选差异基因，limma包做差异分析要求数据满足正态分布或近似正态分布，如基因芯片、TPM格式的高通量测序...
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菜🐣日记-转录组edgeR分析差异基因及案例演示菜🐣的第一次正式上手R，相当于翻译了 edgeR 这个包的 UserGuide，跑了第一个 case眼看写了这么多字，还是发一下比较好，万一有人看呢 edgeR简介 edge...
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R语言包的安装、更新、卸载、加载、位置
我的博客：我的博客地址[http://www.ikeguang.com/] R语言之所以在数据分析与数据挖掘方面很强大，其实是依赖于一些特定的包的，使得R语言可以几行代码完成...
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跟着Nature学作图：R语言ggplot2画带有置信区间的折线图展示核心基因和非必需基因的数量论文 A chickpea genetic variation map based on the sequencing of 3,366 genomes 本地存储 s4158...
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可能会用到的R语言包~41 webshot 在 生信星球 公众号看到的推文 听说你的桑基图也无法保存？ 主要功能是可以把html文件保存为 png 或者 pdf 格式 2 pez 系统全面的系统发育...
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R基础笔记——R语言包的安装
R基础笔记——R语言包的安装 （2021-06-22更新） R语言之所以强大，很大的原因在于强大的R语言包。用过R的人都有个体验就是，每当我们要用R来做一件事情的时候，不免第...
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2020.12~今，深圳湾实验室，助理研究员<br><br>2018.01~2020.12，南方科技大学博士后<br>研究方向：疾病基因组学，遗传学，可变剪接/可变多聚腺苷酸化（polyadenylation)<br>学习研究生涯中一直受惠于网友大拿们写的博客，今后也希望将平日积累及日后总结分享出来与同道交流。
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上海交通大学医学院
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R语言的安装
你可能会问“ Why should I use R？" 1.从上面图中，我们可以看到R是数据科学家招聘广告中最受欢迎的五种语言之一； 2.免费 3.功能广泛：R是一种非常通用...
